主要有大气放电过程(主要指雷电)产生的天电干扰；太阳、星球及整个银河系电磁辐射引起的宇宙干扰；电离层、磁层带电粒子在近地空间的无规则电磁辐射，地球极光和辐射带的电磁辐射引起的干扰；地形地物、水面和气象现象对电磁波的反射引起的干扰等。强烈的自然干扰可使军用电子设备效能降低，甚至失灵。