1961年9月，分属航埠区航埠、河东公社。

1984年1月，复设航埠、河东乡，属航埠区。

1985年7月，航埠乡改称航埠镇。

1992年5月，河东、沟溪乡并入航埠镇。

1996年，沟溪乡析出。

2001年12月，划归柯城区管辖。

截至2011年末，航埠镇辖万川、枧头、官田、长泽街、大力口、航埠、大桥头、彭村、毛村、墩头、安里、邵家、殿前、北二、北一、将军叶、视陈、刘山、黄泥山头、王家坂、垄中、周家山、下於头、汪家、上缪、下缪、上万、金万、曹门、下河东、上河东、上塘周、严村、孙家、翁家、姚家、横源塘、三十六亩、莫家、陈村坞、塘下、外前坞、何双蓬43个村民委员会；下设315个村民小组。

截至2020年6月，航埠镇辖1个社区、32个行政村：兴航社区、万川村、枧头村、航埠村、彭村、毛村、墩头村殿、前村、北一村、北二村、上万村、金万村、曹门村、下河东村、严村、孙家村、姚家村、翁家村、横源塘村、何双篷村、三十六亩村、莫家村、长泽街村、大力桥村、陈安村、将军叶村、雨灵山村、西果源村、汪周村、缪村、新山村、上河东村、上塘周村；镇人民政府驻航埠村兴航路45号。

姜家山乡、双港街道相邻，东南与衢江区廿里镇连接，南与华墅乡接壤，西临常山县招贤镇，西北与沟溪乡相连，北接石梁镇，镇人民政府距柯城城区10千米，行政区域面积66.4平方千米。

2011年，航埠镇有耕地面积4.1万亩，人均0.8亩。

截至2011年末，航埠镇辖区总人口51082人，其中城镇常住人口2149人，城镇化率4.2%。另有流动人口4000人。总人口中，男性25819人，占50.5%；女性25263人，占49.5%；14岁以下5797人，占11.4%；15~64岁39863人，占78%；65岁以上5422人，占10.6%，总人口中，以汉族为主，达47878人，占93.7%；有畲、壮、布依、土家等15个少数民族，共3204人，占6.3%，其中畲族2073人，占少数民族人口的64.7%；壮族232人，占7.2%。人口密度为每平方千米770人。

截至2019年末，航埠镇户籍人口为51937人。

2011年，航埠镇财政总收入2430万元，比上年增长19.0%，其中地方财政收入1059万元，比上年增长-17.0%。人均财政收入476元，各类存款余额5.99亿元，各项贷款余额1.9亿元，农民人均纯收入5763元。

2019年，航埠镇有工业企业52个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市3个。

2011年，航埠镇农业以种植业为主，农业总产值1.8亿元，比上年增长1.2%，农业增加值占全镇地区生产总值的21.4%，生产粮食2119吨，其中稻谷726吨，玉米211吨，豆类692吨，薯类490吨，柑橘种植面积3.8万亩，产量5.4万吨；油料作物种植面积2546亩，产量400吨，其中油菜籽228吨；蔬菜种植面积6128亩，产量9193吨，生猪饲养量21155头，年末存栏9179头；牛饲养量1293头，年末存栏671头；羊饲养量2805只，年末存栏1742只；家禽饲养量38.8万羽，上市家禽24.8万羽，生产肉类1930吨，其中猪肉997吨，牛肉124吨，禽肉809吨；蜂蜜75吨，蜂皇浆1805千克，农民住宅四旁树木4万株，林木覆盖率83.4%，活立木蓄积量3.5万立方米，大型农业机械2台（辆）。

2011年，航埠镇工业总产值6.3亿元，比上年增长21.6%，工业增加值占全镇生产总值的10.8%，规模以上工业企业11家，实现工业增加值1.2亿元，比上年增长21.0%。

2011年末，航埠镇有商业网点1180个，职工7000人，社会商品销售总额达11.8亿元，比上年增长15.3%；城乡集市贸易成交额0.5亿元，比上年增长8.0%，出口434万美元，比上年增长11.5%。

2011年末，航埠镇邮政业务收入230万元，全年电信业务收入800万元。

2011年末，航埠镇有幼儿园27所，在园幼儿1408人，专任教师67人；小学4所，在校生2266人，专任教师146人，小学适龄儿童入学率100%；初中1所，在校生1071人，专任教师98人，初中适龄人口入学率、小升初升学率、九年义务教育覆盖率均达100%，教育经费达3505.6万元，国家财政性教育经费3155.2万元，财政预算内教育经费2655.7万元，预算内事业费2655.7万元，分别比上年增长10.5%、12.4%、12.7%、12.6%，财政预算内教育经费占财政总支出的比例为38.6%。

2011年末，航埠镇有文化专业户9个，镇文化站1个，村文化中心35个；公共图书室34个，藏书1万册。

2011年末，航埠镇各级各类医疗卫生机构26个，病床90张，固定资产总值1949万元。专业卫生人员51人，其中执业医师24人，执业助理医师9人，注册护士11人，医疗机构（门诊部以上）完成诊疗6.1万人次，农村安全饮用水普及率70.8%，农村卫生厕所普及率75.7%，新型农村合作医疗参合人数4.6万人，参合率95.6%。

2011年，航埠镇城镇最低生活保障户数4户，人数8人，支出2.04万元，比上年增长10.3%，月人均212元，比上年增长16.0%，农村最低生活保障户数728户，人数1245人，支出157.5万元，比上年增长20.6%，月人均105元，比上年增长15.0%；医疗救助50人次，支出70万元，国家抚恤、补助各类优抚对象125人，抚恤事业费支出108.3万元。社会福利费35万元。敬老院2家，床位98张，收养五保老人75人；社区服务中心24个，经常性社会救助站、点和慈善超市1个，全年接受社会捐款2万元，使198人（次）困难群众受益，城镇居民基本养老保险参保人数24151人，参保率90.0%。

2011年末，航埠镇有邮政网点1个，投递路线单程总长度98千米，乡村通邮率100%，电信企业2家，服务网点28个，固定电话用户1.1万户，移动电话用户4.2万户，宽带接入用户8000户。

2011年末，航埠镇镇区自来水厂1座，铺设干线水管1.6千米，生产能力600吨/日，年工业用水6万吨、生活用水15万吨，居民自来水普及率95.0%；排水管道1.8千米，污水治理工程1项，日污水处理能力600吨。

2011年末，航埠镇镇区拥有220千伏变电所1座，主变压器2台，总容量37兆伏安，高压输电线路2条，总长度14.7千米，用电负荷2906.5千瓦，年售电量累计完成2903万千瓦时。

2011年末，航埠镇镇区有公园1个，公园面积7.5公顷，园林绿地面积6.7公顷，其中公共绿地5.8公顷，绿化覆盖率35.0%。

2011年末，航埠镇有铁路衢常支线过境，境内长9.7千米，沪昆（杭金衢）、京台（黄衢南）高速公路过境，其中沪昆高速公路境内长5千米，双向4车道；京台高速公路境内长300米，双向4车道，沪瑞线国道过境，境内长7.4千米，县乡（镇）级公路5条，总长41千米，镇区道路总长度17.1千米，道路铺装面积25.7万平方米，镇区桥梁2座，总长度0.7千米，镇区公交汽车线路3条，运营里程达19.5千米，年客运量36.5万人次。

航埠镇因镇人民政府驻航埠村得名。

航埠镇有乌石山、蓝氏宗祠、严村等景区。

乌石山，为航埠各山之首，位于航埠镇与华墅乡交界处，又是柯城区、江山市、常山县三县分界境，海拔800米，山顶周围巨石如城，方塘如镜，古树成荫，山上福慧填寺系唐龙纪年（899年）通济大师结矛于此所建。宋岳飞曾在此题名于石壁云：“岳飞奉旨赴阙，复如江右、假宿幽岩，游上方览山川之胜，志期为国，速欲扫平黠虏，恢复舆图，迎二圣于沙漠，辅圣主无疆之休。绍兴三年十月初三题。”以后又有张浚、翁洮题词作诗，从此福慧禅寺香火连年不断。“文革”期间遭破坏，1989年，经修复为西山佛教胜地。

航埠镇蓝氏宗祠，坐落在衢州城西13千米的柯城区航埠镇北淤村，为少数民族畲族蓝氏祠堂，坐北朝南，三进二明堂，平面总体布局纵长方形，内有戏台一座，台顶草架有天花及复斗形藻井，皆施彩绘，梁柱间保存了不少贴金匾额和对联，还有清代文人题写的遗墨，明间阑额上悬“种玉堂”匾。建筑的雕饰构件多有人物、花鸟、走兽等各种图案。蓝氏宗祠建于崇祯十五年（1642年），清嘉庆十七年（1812年）重修，仍保留了明末建筑风格。

严村，位于航埠集镇的西北面，南临常山港，北靠常河公路，与集镇隔江相望，距离市区约12千米，距离镇政府约1.5千米。迄今有730余年历史，系富春江严子陵后裔，从桐江（庐）迁入，以严、孙、陈等诸姓为主，有苗族16人，余皆汉族，为衢州椪柑、衢桔的发源地。整个村庄自然环境优美，有1100米的常山港沿线，且有11大樟树、50余棵小樟树的古樟树群，占地10多亩，为游人避暑休闲的胜地，严村是文化特色村，为“西安高腔”的发源地，2005年，严村已投资77余万元，建造了占地640平方米的村农民文化中心。

航埠镇农产品有柑橘，绿色环保农产品有衢州椪柑。

2021年9月，航埠镇入选“2021年全国千强镇“。