主要目标是保障航天员长期在轨健康生活和高效工作，是医学与工程相结合的系统。航天员系统的主要任务是“培养人、保障人、研究人”三大块：一是“培养人”，即建立一支结构合理、规模适度、素质过硬、作风优良的航天员队伍，为载人航天飞行任务选拔训练合格的乘组；二是“保障人”，即构建完善的健康保障、生活保障、工作保障体系，制定载人飞行器医学/工效学要求并实施评价，为航天员在轨飞行提供保障；三是“研究人”，即探究解决人类相关空间生命科学问题，掌握发展先进的健康保障和人因工程技术，为载人航天创新发展和未来载人深空探测提供持续的理论和技术支撑。