芥菜基因组

更新时间:2022-08-25 17:59

芥菜(Brassica juncea,2n=36,AABB)是十字花科重要经济作物之一,根据禹氏三角可知芥菜是由芸薹(Brassica campestris,2n=20,AA)和黑芥(Brassica nigra,2n=16,BB)杂交后加倍形成的异源四倍体。

背景

芥菜属于芸薹属的一类重要蔬菜,包括榨菜大头菜雪里红等。测序材料为芥菜的一个变种(榨菜,Brassica juncea var.tumida)。

基因组信息

测序材料为榨菜T84-66,基因组完整性达到85%,采用从头+同源+转录组结合的方法在芥菜基因组中获得了80050个编码蛋白的基因,其中有97.8%的基因可以注释到Nr库。

主要结果

延伸

芥菜基因组公布后,关于芥菜起源问题一直悬而未决。2018年,中国科学家综合运用基因组学、进化生物学等技术手段,从基因组水平上揭示了芥菜为单一起源,大头菜(根用芥菜)变种最早在中国分化,明确了芥菜的起源中心在中国,计算出芥菜不同类群分化形成时间。

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