空和荧是一对旅行中的双子，远渡重天，曾经跨越诸多世界。在降临名为“提瓦特”的大陆之前，他们希望能与这个世界相处愉快。荧先于空苏醒，与坎瑞亚宫廷卫队的“末光之剑”戴因斯雷布共同游历提瓦特。之后众神一同降临，覆灭了坎瑞亚。戴因斯雷布身受不死诅咒，流浪荒野，只能看着他想要守护的人民，化作深渊的怪物。

坎瑞亚的灭亡导致天变地异、灾祸横行。被称为“黄金”的炼金术士莱茵多特堕落为了罪人，孕育了大量漆黑的魔兽。荧从陨星中唤醒空，要和他一同离开提瓦特。但此时天理的维系者出现，拦在双子面前。荧被维系者带走，后因未知原因逃脱；空则被神封印，直到五百年后才醒来。

五百年前，荧和戴因斯雷布在须弥旅行的途中。荧与一位自称“埃德”的坎瑞亚人相遇，并发现了一位躺在床上但却昏迷不醒的丘丘人。埃德为荧讲述了有关“坎瑞亚”的人文情怀与他们的立场。原来埃德是坎瑞亚的王室贵族，但他一直不满家族为他安排的生活，也因此结识了一位具有蒙德血统的女子。而那位丘丘人便是他们生下的坎瑞亚与蒙德混血儿“卡利贝尔”。由于坎瑞亚降下的“不死诅咒”：纯粹血脉的坎瑞亚人不会因“诅咒”变成魔物，但却被剥夺“死”的权利，而来自其他地区背弃神明的人们与坎瑞亚人生下的后代都将会变成魔物。因此年纪尚小的卡利贝尔最终当着父亲的面变成了丘丘人。

埃德为了能让他的孩子卡利贝尔好起来，便为荧介绍了一种被列为禁药的药物，但在药物成型后，需要借助“智慧之神”的力量来唤醒卡利贝尔的神智。可当药物喂给卡利贝尔时，却祈求无果，埃德决定再试一次。然而就在中途，埃德误以为卡利贝尔走了出来，于是埃德便与荧便跟了上去。当埃德发现不是卡利贝尔后，好奇心驱使他们跟着丘丘人进入一座无名的“圣所”中一探究竟。

最后荧和埃德来到了圣所的终点，看到了一块自称罪人的巨大水晶被锁链悬挂在半空。而不信神的埃德对这般伟大的存在彻底臣服，于是虔诚跪拜，随后水晶便赋予了埃德一种特殊力量，察觉到不安的气息的荧与埃德离开了圣所。离开后的埃德认为自己刚才的虔诚，可以唤醒卡利贝尔的神智，于是将重新制作的药物再次喂给卡利贝尔。奇迹突然发生，服完药的卡利贝尔恢复了神智。

但埃德与荧再一次回到圣所，想感谢那位神秘的罪人神明时，却发现那块巨大的晶体消失了。返回之后埃德与荧又发现卡利贝尔不见了，于是出门寻找。来到悬崖边后，埃德与荧找到了卡利贝尔，但卡利贝尔却摘下了面具，瞬间，一股“深渊力量”从他体内迸发。随后荧从床上醒来，而卡利贝尔最终不知所踪，埃德也告诉了他的真实身份，他真实名其实叫“克洛达尔·亚尔伯里奇”。克洛达尔表示他被“深渊”彻底吸引，为此之后在“深渊教团”打下基础，创立了“命运的织机”这一概念。

在这次的经历之后，荧就已经下定决心要走深渊的这条路了。

莱茵多特的炼金造物魔龙杜林从海上升起，循着歌声来到蒙德，想告诉蒙德人它出身的地方有多么美丽。然而杜林身上的剧毒腐液随其展开的双翼弥散天空，黑雨从云端纷扬而下，使大地荒芜。最终杜林被风神巴巴托斯及其眷属东风之龙特瓦林合力击杀于雪山之上。特瓦林因此饮下杜林毒血，因浸透脏腑的剧痛而昏睡。

五百年后，荧统领坎瑞亚遗民组成的深渊教团对抗天理，以深渊淹没神座为目标。她令深渊教团用谎言和咒术腐蚀特瓦林，试图将它转化为战争兵器。这个计划最终因为苏醒的空的介入而失败，荧下令让深渊教团绕开空的行进路线。

之后，荧启动新的计划——命运的织机：以深渊教团早年偷走的一座风神像为基底，接合魔神奥赛尔的肢体，制造机械魔神。若能将世上第一座耕地机的眼睛放在神像手中，就能赋予新生的污秽魔神“动摇天空岛上神座”的力量。这个计划同样被空所阻碍，世上第一座耕地机的眼睛被空和戴因提前找到藏好。在空与戴因前来毁灭污秽逆位神像时，荧帮助深渊使徒挡住了戴因斯雷布的攻击，并与空见面，告诉他深渊教团的目标，约定在旅途的终点再见。

从纳西妲可以接触到的记录中，旅行者的血亲是忽然出现于坎瑞亚的。在坎瑞亚灾变以后，她踏上了走遍提瓦特各国的旅行。可是在她的旅程即将结束的时候，世界树中有关她的记录又忽然间模糊掉了。能确定的是，似乎有人在为了某种理由而刻意掩盖她的「命运」。既然能做到这一点，那个家伙必然有着非凡的能力。有一个值得注意的点，据纳西妲所知，在愚人众的情报体系中，他们也并未将旅行者的血亲列入「降临者」的范畴。

在命运的织机——卡利贝尔·亚尔伯里奇的佐助之下，改变了戴因斯雷布的记忆，使其误以为已经将第一台耕地机的眼睛交给旅行者。后来，荧亲身前往与戴因斯雷布交战，戴因斯雷布碍于往日情面未下狠手，最终“眼睛”落入了深渊教团之手。因此，命运的织机正式建成。

卡利贝尔将旅行者带到了他的意识空间中，旅行者才得以和荧见面，荧向旅行者坦白“目前也还没有找到将它的作用完全发挥的方法，不过还有时间，在天理苏醒之前”。