莫斯科舞蹈学院分为中专部和大学部。中专学制为八年，其中中专1至5年级称为低班，6至8年级称为高班。学生通常10至11周岁进校，入学经过严格选拔和挑选。进入高班6年级的时候，学校会再从俄罗斯各地的舞蹈学校中，选拔专业条件比较好的学生转到莫斯科舞蹈学院学习，从而保证他们能够得到更好更系统的培养。一般学生在经过八年专业学习之后，直接进入俄罗斯各个剧院工作，极少数的学生会选择进入大学部学习。大学部学制为4至5年，主要方向有：芭蕾教育、舞蹈编导、舞蹈理论。学院舞蹈学专业设有副博士学位，学制三年。莫斯科舞蹈学院执行的是以中专教学为主，大学教学为辅的教学方针，其中中专部近五百名学生，大学部为百人左右，外国留学生为四十余人，多数来自日本和韩国。