第二，何时何人始立莲池为八祖，已不得而知，一般说法是莲池圆寂后，由其弟子所推尊。不过据数据显示，莲池被普遍接受为八祖，应是清初的事。因为明末正寂的《净土生无生论注》及受教的《净土生无生论亲闻记》，皆未列入莲池。至清初俞行敏（生卒年不详）的《净土全书》（康熙三年〔1664〕成书）才明言莲池为八祖。15 至清道光（1821-1850）年间，悟开的《莲宗九祖传略》，亦将莲池列为八祖，16 后来印光即采用此说（详下文）。悟开另加推省庵为九祖，17 这是省庵被列为祖师的最早文献。18

第三，蕅益及彻悟二人被追尊的时间很晚，以下分两点说明：

（1）丁福保（1874-1952）曾赞誉印光为继省庵之后，得以推为莲宗第一人。当时印光回信说：「何得以省庵之后，推为第一。使光（自称）能为省庵提鞋，当不致搬弄出此种过活，况曰文章夺过乎哉！……阁下爱光虽深，其如自己失言何！须知省庵之后，有大高人，其过与否，不敢以凡情妄断，当在比肩齐驱之列，其学问、见地、操持、德业，绝无稍逊者，彻悟禅师也。莲宗十祖，当之无愧。光尚不敢谓为后裔，况曰同列乎哉！」19 据该信内容推断，印光写此信时仍住于法雨寺，20 所以说，至少在民国十七年（1928）以前，蕅益、彻悟尚未被视为莲宗祖师。因当时印光尚认为彻悟可以继省庵之后，被推为第十祖。

（2）印光在民国廿一年（1932）底，在给信徒的信中仍说省庵是莲宗九祖。21 此亦可说明印光在此之前，仍依照悟开的九祖说，尚未视蕅益、彻悟为莲宗祖师。

第四，行策被印光确立为祖师的时间应于民国廿七（1938）、廿八（1939）年之间。今据两条线索加以说明：

（1）清乾隆年间（1736-1795），彭际清（1740-1796）命其侄彭希涑（1760-1793）编纂《净土圣贤录》（1783年成书），其中共收入五百余传。至道光（1821-1850）末年，胡珽（生卒年不详）又辑乾隆以后往生者一百六十余传，名为《净土圣贤录续编》。民国廿二年（1933），印光命其弟子德森（1883-1962）辑咸丰（1851-1861）以后往生者近二百三十传，名为《净土圣贤录三编》。以上三本圣贤录经印光修改订正之后，于民国廿二年合订出版流通。22 此版本的目录，曾在各祖师的名下以小字标列祖序，其情形如下：

《净土圣贤录》 ：卷二，晋慧远（其下小字注明：莲宗初祖）

〃 ：卷二，唐善导（〃 〃 ：莲宗二祖）

〃 ：卷三，唐承远（〃 〃 ：莲宗三祖）

〃 ：卷三，唐法照（〃 〃 ：莲宗四祖）

〃 ：卷三，唐少康（〃 〃 ：莲宗五祖）

〃 ：卷三，宋延寿（〃 〃 ：莲宗六祖）

〃 ：卷三，宋省常（〃 〃 ：莲宗七祖）

〃 ：卷五，明袾宏（〃 〃 ：莲宗八祖）

〃 ：卷六，清智旭（〃 〃 ：莲宗九祖）

〃 ：卷六，清行策（其下无小字注明祖序）

〃 ：卷六，清实贤（其下小字注明：莲宗十祖）

《净土圣贤录续编》 ：卷一，清际醒（〃 〃 ：莲宗十一祖）23

以上小字标示莲宗祖序，是印光的意思，24 因此可以得知，至民国廿二年印光心中的诸祖人选还只有十一位，行策尚未入祖师位。但蕅益及彻悟（际醒），已被选入。

（2）印光的《文钞》里收有〈净土宗祖堂赞〉一文，标明作于民国廿七年（1938），25 另又收有〈莲宗十二祖赞颂〉，26 虽未标明作于何年，但从印光写给张觉明的信，可推知此赞颂撰于民国廿七年底至廿八年初之间。27 由此看来，印光确立十二祖的时间应在1938～1939年之间。印光在给张觉明的信中明言：「十二祖，即世称莲宗九祖，于八祖莲池大师下，加蕅益为九祖，截流为十祖，以思齐（实）贤九祖为十一祖，下又添彻悟禅师为十二祖。」28 这里所谓的「世称莲宗九祖」即上文所述，以悟开《莲宗九祖传略》所选之九祖为依据。而「加蕅益为九祖，截流为十祖……」所言，即明确表述出行策（截流）祖位的确立。

第五，印光立蕅益为莲宗九祖曾遭受到质疑，提出质疑的圣严法师（1930-）说：「目前，中国佛教界传行的十三祖说，其排行是：慧远、善导、承远、法照、少康、延寿、省常、宗赜、袾宏（莲池）、智旭（蕅益）、省庵、际醒（彻悟）、印光。事实上，智旭已是第十代祖师。假定依从《佛祖统纪》和《生无生论注》，以及《九祖传略》的主张，而把宗赜剔除，那么，智旭就可以做为第九祖了。」29 但此质疑自身有些问题。首先，圣严所列的十三位祖师，不知根据何处，现今通行的莲宗十三位祖师应如本文前言一节所示，圣严少列了行策，且增列了宗赜。而且圣严为了将蕅益往前推为九祖，遂将宗赜剔除，但宗赜一经剔除，就只剩十二位祖师而已，此乃其失察之处。再者，蕅益是否应为九祖恐怕不是圣严论述的重点所在，其要旨乃为了推翻弘一（1880-1941）所言「清莲宗九祖非天台宗下智旭大师」一语里的「非天台宗下」的说法。30 他说：「据智旭〈儒释宗传窃议〉的记载，净土教的祖师，与此有相当地不同，是即：慧远、智顗（538-597）、遵式（964-1032）、飞锡（生卒年不详）、唯则（？-1354）、梵琦（1296-1370）、妙?（生卒年不详）、传灯（生卒年不详）、袾宏、德清（1546-1623）等的十二位，我想这可能是依思想与著作为准据，加以挑选出来，如果是非常仰慕智旭净土思想的人，就把智旭安置为第九祖，着实而言，这种做法也不能算是很妥当。」31 这应是圣严法师主要的反驳理由。但是，蕅益以思想跟著作为立祖根据，只是蕅益本人的见解，与他人立蕅益为莲宗祖师并无冲突。况且历代的祖统说一直在变动，各人的立祖观点常不同。弘一的立祖观念是依据印光而来，32 可视为近代修持净土法门者的一种观点。

此外，蕅益是否确属于天台宗门？属天台宗是否即不可被立为莲宗祖师？这是可争议的。圣严法师曾评论蕅益说：「（蕅益）智旭之所以把念佛法门，摆在一切法门之上，……因此，即使没有《天台止观》，只要念佛就可以了，他认为这才是一切法门的首要，我们应该把这件事，看作是智旭信仰佛教的最后结晶。」33 又云：「所谓横出三界的胜异方便，就是阿弥陀佛所说的『称名念佛』。而竖出三界的念佛三昧，是依禅观的自力修行，而渐次断灭三惑烦恼，从而感得三身四土的。至于横出三界的『称名念佛』，是依阿弥陀佛的本誓愿力，被接引往生至极乐世界。……在智旭本身，虽亦致力于念佛三昧的鼓吹，但在五十岁以前，他是以禅、教、律合一的立场来主张的，到了晚年，他于净土教的色彩，则更超浓厚，完全是献身于他力往生的横出三界的胜异方便。」34 据圣严法师对蕅益的研究结果显示，蕅益愈到晚年愈注重持名念佛，甚至献身于此。既然如此，印光列蕅益为莲宗祖师，是非常恰当的。而且，圣严法师亦自言，蕅益的思想基础不是以《法华经》为中心，他只是采用天台教观的方法来注释经论，以呈现自身的思想面貌，因此不可判属蕅益为天台宗门。35 基此，弘一所言的「清莲宗九祖非天台宗下智旭大师」一语甚为的当，蕅益被列入莲宗祖位，是无须质疑的。

另外，日人牧田谛亮（1912-）认为志盘《佛祖统纪》所立的「莲社七祖」，颇能传承善导持名念佛的教法，八祖云栖、九祖蕅益则未必如是。而十三祖的印光最能坚持承继善导的教法。36 印光的确最重持名念佛，不过吾人须知，在印光眼里，蕅益也是真正持名念佛的继承与发扬者。印光对蕅益的著作与思想非常了解，于诠释持名念佛时常引用蕅益的说法，除了彻悟外，最受印光重视与尊敬的就是蕅益了。

第六，印光如何被立为祖师？印光被立为祖师的经过非常简单，他住世时四众弟子便常将他与莲宗诸祖并论，37 誉他为「当代净宗泰斗」、38 「净土宗匠」，39 或尊他为省庵之后的第一人。 40印光圆寂不久，福建的杨石荪旋及倡议尊印光为莲宗第十三祖，41 此议获得绝大多数人的同意。因此，印光的祖师地位就此确立。但当时亦有不同的意见，曾有人向李炳南（1889-1986）提问：「印光大师往生后列为莲宗十三祖，此事乃系暂时性，尚未确定，未确定之缘由，盖因福州鼓山涌泉寺住持高僧虚云大师，及圆瑛大师尚未圆寂，须俟二位高僧往生后，佛教会方能作最后之决定。」而李居士的回答是：「名分已定，人心已归，岂能朝三暮四，随意变更。况虚公为当代禅德，自有其本宗地位，瑛师禅净双修，如紫柏、憨山诸师相同，后人自然奉之为祖，但不必定以数字相承而别也。」42 有此提问，表示当时尚有不同的意见存在，然印光的祖位最后还是被公认而确立下来。另外值得附带一提的是，道源长老（1900-1988）曾于1954年推举慈舟法师（1877-1958）为莲宗十四祖， 43但此提议未能得到教界首肯。又毛凌云（1910-）居士亦曾呼吁净宗四众，奉道源法师为莲宗第十四祖，44 亦未被广泛认可。从以上两例得知，欲被立为祖师，必经大众检证，才会被接受。

在推尊印光为十三祖的诸大德中，太虚（1889-1947）的说法最具代表性。他在〈莲宗十三祖印光大师塔铭〉中指出：

师（指印光）志行纯笃，风致刚健，亲其教、览其文者，辄感激威德力之强，默然折服，翕然崇仰，为莲宗十三祖，洵获其当也。45

太虚与印光交往颇深，46 对印光认识深刻，故其尊崇印光「为莲宗十三祖，洵获其当」，绝非一般交际应酬的话。而且，太虚此文写于民国三十二年（1943）秋，离印光圆寂已有三载，事经三年之后太虚仍肯定印光的祖师地位，足见印光的祖位得到教内一致的认同。

自从石芝宗晓的《乐邦文类》立下莲宗六祖后，陆续有人为有贡献的大师立祖，直到今日，形成莲宗十三祖说。民国廿八年之前，八～十二祖的祖位及人选还处于相当混乱的情况，最后经印光确立而成定局。印光圆寂之际，其弟子旋尊他为第十三祖，可见现行的莲宗十三祖说乃于民国廿九年（印光圆寂之年）确立。

再者，这十三位祖师彼此未必具有师承关系，例如二祖善导远离初祖慧远两百年，善导的净土思想继承昙鸾、道绰，与慧远风貌有别；七祖省常往生于公元1020年，八祖莲池却在公元1532年才诞生，中间隔了五百年。足见净土宗的立祖目的是为了崇敬有功之大师，令后人产生儆仰，激励上进，跟其他宗派（如禅宗、天台）师生间之传承，意味不同。

慧远大师（西元334——416年）姓贾，雁门楼烦（今山西宁武附近）人，精通六经及老、庄之学。年二十一，闻道安法师讲般若经，悟而出家，以弘法为己任。后入庐山，喜其清幽，遂结茅为舍，讲《涅盘经》，刺史桓伊惊其才，奏立佛寺，感雷雨运木以建东林寺，又凿池种莲，因号莲社，集众六时念佛求生西方，是为中国莲宗之始。在山三十余年，虽帝诏亦不出，闻鸠摩罗什入关，即修书问道共商疑难，互证心得，道风遐播，群贤皆趋。初结社念佛时，即有一百二十三人参加，悉属法门龙象，儒家泰斗，乃命刘遗民作文勒石以明所誓。终公之世，共入莲社修净业，蒙接引而得往生者甚多，东林寺遂为南方佛教中心，与北方长安鸠摩罗什之逍遥园遥为呼应。义熙十二年，睹佛再现，乃端坐入灭，年八十有三。葬山之西岭，累石为塔，谢灵运撰碑文。遗著有：

庐山集十卷。

大智度论要略二十卷

问大乘中深义十八科三卷等

慧远之结社念佛，是依念佛三昧法见佛而求往生。当时《观经》尚未传译，所以其思想是基于《般舟三昧经》。以三昧是专思寂静，则气虚神朗，自发鉴照之智，得透彻幽微。然而种种三昧中，念佛三昧最功高进易。因为如来是穷玄极寂，体神合变，随宜应物，所以使入此三昧著，寂然忘知，就所缘之境，成就鉴智，此是说明若一心专念，止寂他想，则鉴照之智自发，而得见佛之境界。慧远圆寂后，道昺为东林精舍之主，昙恒、昙诜等亦皆止于山中，宣扬远师遗风。同时诸弟子或莲社结众，多游化诸方，从而净土信仰传布各地。

善导大师（西元613——681年）是临淄人（今山东淄博市），生于隋大业九年，少年出家，看见西方图，颇有所感，夙期往生净土，受戒之后，和妙开律师共读《观无量寿经》，晓得此经的观门是解脱生死之法。唐贞观中，到并州去拜谒道绰大师，授予念佛往生的法门。进入长安，广度民众，写了数万卷《阿弥陀经》，画了三百卷的极乐净土图。最初住过终南山，常常来光明寺说法。晚年住过长安实际寺，又管理著龙门奉先寺洞的营造。大师为人，护持戒法，未曾举目而见女人，心不念名利。平生以乞食为生，粗衣淡饭，受持峻严，而对人慈爱宽恕，信念坚强。在西京寺内，与金刚法师议论念佛胜劣之时，善导说：‘念佛往生如果是真实的话，堂内的诸像就要放光出来，假如是虚妄的话，就要随我堕地狱去。’这个时候，堂内的诸像，都放出光明来，这是很有名的故事。以长安为中心，受大师感化的人非常多，其中企图舍身往生的人也有。遗著现存六部十卷。

观无量寿经疏 四卷 又名观经四帖疏

往生礼赞记 一卷

法事赞 二卷

般舟赞 一卷

观念佛法门 一卷

依经明五种增上缘义 一卷

临终遗示云：‘大圣悲悯，直劝专称名字者，正由称名易故，何以故？无杂缘得正念故，与佛本愿相应故，不违教故，顺佛语故。若舍专念修杂念者，百中稀得一二，千中稀得三四。’

南岳承远大师四川绵竹人，年二十四岁，至荆州玉泉山就惠真披剃，公令居衡山设教，从其化者万计，一以念佛开导之。闻慧日游化广州，远往乞教，慧日示以独善为不可，应依《无量寿经》修念佛三昧，以救济群众，自此顿息诸缘，专修净土。天宝元年，归衡山，立精舍，号弥陀台。仅安置经像，粗食弊衣，清苦修道，恒见圣境。以专持名号为正行，以布施，持戒为助行，贞元十八年入寂，终年九十一岁。后名其居于般舟道场，教导四众，前后受法弟子千余人。《佛祖统纪》列为莲社第三祖。

五台法照大师，以念佛三昧为无上深妙禅门。极力指责禅徒之不拜佛、不立文字，以用音声语言为执相，自舍万善诸行住空见，而鼓吹五会念佛法。以修此法能速成就五分法身。此法是依心念口称之法而获得三昧。其主旨本与善导、怀感等之口称三昧相同，但他为警策自他之信心，且成就三昧方法，而定五会念佛仪则，教合五音曲调，唱佛名号。五会念佛：第一会是平声缓急，第二会是平上声缓急，第三会是非急非缓，第四会是渐急急，以上四会皆唱‘南无阿弥陀佛’六字，第五会是转急急，而只唱‘阿弥陀佛’四字。

新定少康大师，周姓，缙云人，年十五，诵《法华》、《楞严》等经，后往越地究毗尼学，及听《华严》、《瑜伽》诸论。贞元初，诣白马寺，得善导之《西方化导文》，大喜。至长安善导影堂瞻礼，感见导之真身。后到睦郡，在城内乞食得钱，诱掖小儿、念佛者给钱，竟至佛声盈路。寻于乌龙山建净土道场，筑坛三级，众皆日夜行道唱赞。每逢斋日，云集三千许人，众见师高声念阿弥陀一声，由其口出一佛，十声连诵，则十佛如连珠现出。师之法门，系以厌秽欣净，高声念佛，兼行布施，为其行业。常示众云：‘当于净土，起欣乐心，于阎浮提，起厌离心。’于贞元二十一年迁化，身放光明，塔于台子岩，故又号台岩法师。其乞钱给儿至佛声盈路，亦志高行苦者矣。

永明延寿大师（西元904——975年）临安府余杭人，俗姓王。二十岁时一心归佛，日中一食，常诵《法华》。年二十八，为华高之镇将。年三十乞吴越王，舍官位，投龙册寺翠岩禅师门下剃度出家，行苦行头陀。然后去天台山天柱峰下习定九旬，又参谒法眼嫡嗣德韶，韶一见深器之，授以密旨，有所契悟。后于国清寺修法华忏，于智者禅院曾作二阄，一是‘一心修禅’，一是‘诵经万善，庄严净土’，拈七次皆属‘万善’之阄，遂决心不但修禅定，且誓力诵经万卷。后周广顺二年住雪窦山，宋建隆元年受吴越忠懿王邀请，复兴杭州灵隐。明年迁往永明寺，随学者千余人，曾作偈曰：

欲识永明旨，门前一湖水，日照光明生，风来波浪起。

寿公住永明十五年，为七众授菩萨戒，时人尊为弥勒下生。夜为鬼神施食，放生无数。诵《法华》一万三千部，道誉东海。高丽国光宗大成王闻之，遣使前来求教，赍书执弟子礼，奉献金丝织成之大衣、紫水晶念珠、金汤罐，并派僧三十六人来学。寿公传授要旨，归高丽后，弘扬大法，于是法眼一宗流衍于东海。寿公日行百件佛事为常课。其中重要者：受持神咒、念佛、礼佛、忏悔、诵经、坐禅、说法。每日虔礼十方十佛：释迦、文殊、普贤、弥勒，观音、势至等，每夜于旷野施食于鬼神等。寿公发愿求生西方、日念弥陀圣号十万声。日暮时住别峰念佛，随众常数百人。清宵月明之夜，时闻螺贝天乐之声。吴越忠懿王深深敬重其德，闻此大受感动，为建西方香严殿以成其志，号智觉禅师。宋开宝八年十二月，以七十二高龄圆寂于永明寺。著作甚多：《宗镜录》一百卷、《万善同归集》六卷、《神栖安养赋》、《受菩萨戒》各一卷等，凡六十余部，可谓一代硕学。其治学，所持之懿行，可与智者大师媲美。

延寿曾作《参禅、念佛四料简偈》可作禅净双修之准则。四料简偈说：有禅无净土，十人九蹉路，阴境若现前，瞥尔随他去。无禅有净土，万修万人去，但得见弥陀，何愁不开悟。有禅有净土，犹如戴角虎，现世为人师，来生为佛祖。无禅无净土，铁床并铜柱，万劫与千生，没个人依怙’此中第三句有禅有净土，即禅净双修，犹如戴角老虎，为最理想，故彼一生实修此一法门。第一句有禅无净土，指当时一般禅宗门徒，彼等十人中修禅，九人堕入魔道。第二句无禅有净土，指一般中下根机，彼等万无一失，只要能够亲见弥陀，自能分离生死。依此可知延寿是利根上智，故禅净双修。钝根下智者，专心念佛，期生净土，何愁不能开悟。此一教化与善导大师可说同一旨趣。

又尝劝人高声念佛和十念往生之说，一声佛名，罪灭河沙。《法华》云：‘若人散乱心，入于塔庙中，一声南无佛，皆共成佛道。’《阿弥陀经》云：若人受持佛名，为一切诸佛之所护念。《宝积》云：高声念佛，魔军退散。《业报差别经》云：高声念佛诵经，得十种功德。又念佛有坐念、行道念。坐念如逆水行舟，行道如顺风行舟，坐念尚能灭八十亿劫罪，若五体投地，恭敬念佛，功德无量。又彼重十念。一生重恶，临终十念，罪灭生净土。引《那先比丘经》教证，如水中投石下沉，投石入船中虽有百枚，亦不会沉没。因造罪者由念佛功德，免于下堕地狱。《智论》云：‘临终时，心力能胜终身行力，是时少许心力，猛利如火，量虽小能作大事。’由于临终之心决定勇健，能胜百岁行力，此为临终十念法门有力之论证。

杭州省常大师，字造微，俗姓颜，钱塘人。生于后周世宗显德六年，十七岁出家受具足戒。生平戒行谨严，精通《大乘起信论》，修习天台止观法门。继庐山远公遗风，于宋淳化中迁杭州西湖昭庆寺，专修净业，并结净行社。自称净行弟子，尝自刺指血和墨书《华严经、净行品》。又以栴檀净香木雕成毗卢遮那像。复跪地合掌发誓愿云：‘我与一千大众，八十比丘始从今日，发菩提心，穷未来际，行菩萨行，愿尽此报身，以生安养。’省常所交者，俱属贤德名士，相国大夫，故碑记特多，天禧四年（西元1020年）正月十二日示寂，寿六十二。

云栖祩宏大师（西元1535——1615年），杭州仁和人，字佛慧，号莲池，十七岁举诸生，以学行称。问邻家老妪日诵佛名之理由，答因先夫持佛名无病而逝，因知念佛功德之不可思议。因感其言而寄心净土，书‘生死事大’四字于案头自警。二十七岁丧父，三十二岁丧母，嘉靖四十五年，遂决意出家。投西山性天寺落发，就昭庆无尘受具足戒，次谒庐山遍融，融谕以不贪名利，唯一心办道，老实持戒念佛。后参严德宝柳庵，辞向东昌途上，闻樵楼鼓声，忽然大悟，乃作偈曰：‘三十年前事可疑，三千里外遇何奇。焚香掷戟浑闲事，魔佛空争是与非。’隆庆五年入杭州云栖山，卜居山中，始修念佛三昧，教化远近，道俗云集，遂成一大丛林。万历十二年编《往生集》，记传古今往生人事迹。二十年在杭州净慈寺开戒，又兴戒坛之制，行自誓受戒法。在山中及城之内外造放生池，制戒杀放生文，诫害物命。常主张净土，著《阿弥陀经疏》等。又痛责禅徒之空腹高心，录永明延寿、高峰原妙等机缘中之吃紧语，以示参究之要决。万历四十三年七月病笃，作‘三可惜十可叹’警众，又遗诫诸弟子‘老实念佛’，遂于八十一岁圆寂。世称云栖禅师，又号莲池大师，尊为莲社第八祖。遗著有：

阿弥陀经疏钞 四卷

往生集 三卷

净土疑辩 一卷

禅关策进 二卷

梵网经戒疏发隐 五卷

楞严经摸象记 一卷

缁门崇行录 一卷

山房杂录 三卷

竹窗随笔 二卷

云栖法汇 三十二卷

宏师又说信愿行为修净业之必须要件，因到净土之资粮若不充足，则不能前进。一、信：信生佛不二，众生念佛则定得往生，究竟得成佛。阿弥陀经之‘汝等皆当信受我语’，即是标此信。二、愿：不单空信，必进而依其教求往生，弥陀经之‘应当发愿生彼国土’即是。三、行：不单虚愿，必亦力行精进，念念相续而不间断，即是阿弥陀经之‘执持名号一心不乱’。

灵峰蕅益大师（西元1599——1655年），江苏吴县人，少时学儒，誓灭释老，作论数十篇攻之。十七岁时，偶阅祩宏《自知录》及《竹窗随笔》，大有反省，焚所著辟佛论。天启元年（西元1621年）二十三岁，发四十八愿，自名大朗优婆塞。翌年一月之间，梦见憨山德清三次。时德清居曹溪，不得从，乃就其门人雪岭剃度。次往云栖听古德法师讲《唯识论》，更上径山坐禅，又受菩萨戒，遍阅律藏。二十八岁染病，决意求净土。以天台为宗，研习其章疏。崇祯四年（西元1631年）始入灵峰，同六年建西湖寺，寻游化各处。永历八年夏，在灵峰卧病，十二月建净社，作愿文，又作求生净土偈，翌年一月以五十七岁示寂。世称灵峰蕅益大师。生平厌弃名利，以阅藏著述为业，终身笔砚不离，故著述甚多。计有《阿弥陀经要解》一卷、《梵网经玄义》一卷、《菩萨戒本笺要》一卷、《法华经玄义节要》二卷、《法华经会义》十六卷、《楞严经玄义》二卷、《楞严经文句》十卷、《阅藏知津》四十四卷、《法海观澜》五卷、《周易禅解》十卷等，凡四十余部。又有《灵峰蕅益大师宗论》十卷。

蕅益主张念佛有念他佛、念自佛、念自他佛三种；以庐山一派之净土念佛，名为念他佛，达摩所传之禅及南岳天台所传之观心，名为念自佛，永明一派之事理双修，名为念自他佛。又以藏通别圆四教悉无不是念佛法门。若此四教各有三念佛，则为十二种念佛。又《摩诃止观》之四种三昧，亦同可名为念佛，若此四种三昧——具有今之十二种念佛，则总为四十八种念佛。又乘念他佛中之念相好、念法门、念实相三种，则总共有一百四十四念佛三昧法。此外又有《弥陀经》所说之执持名号法，而说教禅二宗皆是念佛法门。持戒一心念佛者，必为止恶防非而精进律学，精进律学者亦必须决定往生以一心念佛为事。且持戒是因，净土是果，持戒与念佛，本唯一门。如此念佛统禅、教、律之三学，同时亦为三学之归结，而主倡广义之念佛三昧论。他还认为《阿弥陀经》之执持名号为至简易、至奇特之法，阐明此法是普被上中下三根，又是摄事理之不可思议权巧方便，而劝人应依祩宏等所说之具足信愿行之三种资粮而期望往生。