法蒂玛医学院是目前菲律宾和外国医院建立教研关系仅有的一所医学院校，从1988到2000年法蒂玛已送出了上百名医学生到美国麻州哈佛医学中心，纽约州Brooklyn医学中心见习，二三十年来已有数百位医学、护理、职能治疗毕业生在美国工作，超过千位毕业生在世界各国就业。

法蒂玛大学是达到由菲律宾大学联合会鉴定委员会所规定的在护理、理疗和牙医学专业达标标准的院校。同时法蒂玛医学院已被美国纽约州教育厅、伊利洛州教育厅所认可；它也被美国加州素质教育局所认可，并名列在世界卫生组织（WHO）医学类学校行列。

菲律宾高教署基于法蒂玛大学通过其素质教育、研究及其延伸工作对本国和亚洲太平洋的高等教育成长和杰出巨大贡献以及其所作的义务承诺，按照高教署2003年10月27日颁布的第393-2003号行政令，授予法蒂玛大学自主办学地位。中国使馆推荐该大学为中国学生正式就读院校。