菲德尔·桑切斯·埃尔南德斯在任期间国家面临着战争和经济的动荡与不稳。

曾在华盛顿和巴黎经过军事学习，回国后成为陆军将领。胡利奥·阿达尔韦托·里韦拉·卡瓦略执政时期任政部长（1962年到1967年）。当选为总统后，萨尔瓦多因与洪都拉斯在足球比赛中的胜负而变得关系紧张，1969年7月爆发短暂战争，史称“足球战争”。他命令部队占领了洪都拉斯一半的领土，但却遭到了国际社会的谴责。在美洲国家组织的斡旋下，他才同意停火并撤出所有军队。与洪都拉斯的战争导致许多经济困难的萨尔瓦多难民大批涌向洪都拉斯，洪都拉斯被迫关闭与之的所有相关贸易线路。

他出任总统直到1972年，后由阿图罗·阿曼多·莫利纳接替职务。2003年2月28日死于萨尔瓦多军事医院。