顺治元年（1644），豫亲王多铎兵下河南，董学礼投降，并写信招降大顺政权宁夏提督陈之龙，书信被李自成的部将牛成虎截获，导致家属尽被屠杀。李自成军攻打孟县，董学礼渡河援救，杀敌千余。

顺治二年（1645），随英亲王阿济格平定陕西，署凤翔总兵。后来凤翔不设军镇，奉诏回京，编入汉军正黄旗。

顺治五年（1648），投诚有功，封一等子爵。

顺治十六年（1659），温州告急，加左都督衔，任浙江总兵，驻守温州。

顺治十八年（1661），擢升湖广提督。

康熙三年（1664），李来亨举家自焚，董学礼招降其部将王光兴等人。