嘉靖元年（1522），主考南直隶乡试。

嘉靖三年（1524），升侍讲学士。寻充副总裁官。起初在《明孝宗实录》中，焦芳多以意毁誉其间，而明武宗朝大奸相继乱政，其事庞杂，诸史官相顾不能书，董玘纪载详而不冗，简而能尽，又因以正前录之讹谬，归之至公，其有功于国史甚大，少师费公每举以语人。迁詹事府詹事兼翰林院学士，而忌者谓故事。书成，迁转不越二级，董玘独得五级，于是诽谤始作。其冬，以日讲劳，赐诰命。参与编撰《明睿宗实录》，仍充副总裁。

嘉靖五年（1526），主考会试。寻奉命教庶吉士。秋，实录成，升俸一级。

嘉靖六年（1527），迁吏部右侍郎，仍兼学士，转吏部左侍郎。

嘉靖七年（1528），满三载，诏荫子入国子监读书。冬十一月，闻父丧，诏赐祭葬，给驿以归。起初，董玘在吏部，拒绝请托，尤严于君子小人之辩。御史胡明善所为多不法，董玘疏出之，草已具而讣至，不果上。董玘又薄都御史汪鋐。汪鋐、胡明善怨恨董玘，董玘请求恤典，正值方郊，有司不敢覆请，等到命令下达，则离闻丧已经超过一个月。汪鋐、胡明善诬陷董玘，谓有他觊不肯行而昔之，以请托见拒者纷纷参与构陷，于是下诏撤职。董玘方在疚，不敢自明，其后三年，诬始白，奉诏致仕。南北台谏及御史之按浙者，交章推荐董玘，却不被任用。因母丧，积毁成疾，继以卒。

隆庆初年，赠礼部尚书，谥文简。

高祖父：董升，明初因荐被征召。

曾祖父：董谏，以文行闻名浙江。

祖父：董敬，以文行闻名浙江。

伯父：官至按察佥事。

父：进士，历任黟县知县、云南府知府。

母：章氏

生母：娄氏