然而命运却显得十分曲折，就在蒋燕皎逐渐进入人们视野的起初，巨大的伤病无形降临，再加上年轻时少许不稳定的发挥，使得她的成绩和排名均有所下滑并一度跌出前100名。

2006年的尤伯杯同荷兰队争夺冠军的决赛上，出任第二单打的蒋燕皎意外的负于荷兰队的梅林迪克斯，使中国队险些失守尤伯杯。

2009年3月7日，在全英羽毛球公开赛半决赛中，蒋燕皎在首局险胜，次局大比分领先的大好形势下没有抓住机会，被丹麦猛女拉斯姆森实现了惊天大逆转。

这两场比赛的结果，使得伤病缠身且没有身体和年龄优势的蒋燕皎在教练心中的地位大打折扣。

然而，一切失利并没有击垮蒋燕皎的信心，她自己不断调整状态和总结失败，并且随着伤病的好转，她的状态逐渐向高处回归。

2010年上半年举办的中国羽毛球俱乐部超级联赛中，蒋燕皎以16胜1负的骄人成绩，以超强的优势排在女单队员成绩榜首，再加上她以往在队内比赛的优异成绩，使蒋燕皎被中国的球迷誉为“内战女皇”。

2010年12月5日，在上海举办的中国羽毛球超级赛女单决赛中，蒋燕皎以21:16，21:19，总比分2:0的成绩横扫“近期表现十分出色且两胜外战女皇汪鑫”的师妹队友王适娴，夺得冠军。其中第二局在9:16和16:19两度落后的时刻，利用对手体力下降而连续得分并逆转取胜。此冠军的夺取使蒋燕皎成为了中国羽毛球公开赛（超级赛）自开办以来首位实现女单三连冠的选手，进而使得“后张宁时代”的中国羽毛球女单新一姐位置的争夺愈演愈烈。

2010年12月5日，中国羽毛球公开赛女子单打决赛中，蒋燕皎首局取胜后，第二局在最多落后7分的情况下逆转，直落两局击败队友王适娴，实现中国超级赛的女单三连冠，也是该项赛事历史上首位三连冠女单得主。这个冠军为她竞争国羽主力位置增添了一个重重的砝码。蒋燕皎曾在2008年和2009年连续两次夺得中国羽毛球超级赛的女子单打冠军，本次比赛是她的卫冕之战。她的晋级之路并不平坦，首轮与中华台北选手戴资颖苦战三局方涉险过关，随后她轻取荷兰老将姚洁晋级八强，在1/4决赛中与泰国天才少女拉特查诺的比赛打的格外艰苦，经过一个多小时的苦战方在决胜局以三分优势险胜对手晋级四强。在半决赛中她又击败了中国队2010年尤伯杯女单头号选手王仪涵晋级决赛，在决赛中与同样是多拍跑动型打法的王适娴争夺冠军。

过去蒋燕皎对王适娴保持着较高的胜率，主要原因是两人都是以防守见长的多拍拉吊打法，在多拍的对拉中寻找机会得分，蒋燕皎的对拉和防守能力强于王适娴，虽然进攻不及对手，但总能凭借更为顽强的防守和跑动及出色的体力磨垮王适娴。今天决赛再一次成为两人以往比赛的翻版。

第一局比赛蒋燕皎在多拍的跑动和拉吊中显出了更好的耐心，王适娴总是首先发起进攻，但全部被蒋燕皎防了起来，结果反倒造成了王适娴的体力的消耗和较多的无谓失误，蒋燕皎一路领先拿下了第一局。次局王适娴明显加快了速度，多次劈对角和突击得分，一度以16-9领先，这个时候蒋燕皎仍然没有放弃，还是坚持自己多拍拉吊的打法，尽量打四方球调动王适娴，终于等到了王适娴体力开始下降，此后王适娴在多拍跑动中显得力不从心，多次出现了主动进攻失误和网前的失误，蒋燕皎一度打出7-1的得分高潮，在打成18平以后王适娴体力已经透支，步伐凌乱、回球质量不高，蒋燕皎凭借自己的坚持、耐心、出色的体能拿下了这场球。

中国公开赛自1986年举办至今，还从未有一位女单选手实现过三连冠，周蜜曾经在四年内夺取三冠，但三连冠实在有些难度。中国赛历史上，周蜜和张宁都三次夺冠但并不是连续三年，李玲蔚也只是两次夺冠，蒋燕皎如今三连冠，成为中国赛女单至今表现最出色者。其实2010年以来蒋燕皎的表现很出色，此前她就夺取日本赛冠军和瑞士赛亚军，与外战起伏较大的王琳、卢兰和王仪涵相比，蒋燕皎占据一定的优势，而面对内战时，她的成绩又好于汪鑫和王适娴，2010年羽超联赛取得16胜1负的超高胜率。从教练员将她放在至关重要的尤伯杯第三单打和亚运会团体第三单打上可以看出，教练组让她打决胜盘是对她的实力、技术及心理的稳定性是非常认可的，目前来看她虽然竞争国羽女单“一姐”的可能性不大，但获得一个主力位置还是大有希望的。

2012年世界羽联中国大师赛女单亚军

2012年尤伯杯亚洲区预选赛团体亚军成员

2012年韩国羽毛球超级赛女单亚军

2011年中国羽毛球大师赛女单亚军

2011年印尼羽毛球超级赛女单四强

2011年泰国羽毛球公开赛女单亚军

2011年羽毛球亚洲锦标锦赛女单四强

2011年马来西亚羽毛球公开赛女单四强

2010年中国羽毛球超级赛女单冠军，实现了该赛事女单（首位）三连冠

2010年第十六届广州亚运会羽毛球女子团体冠军

2010年国际羽联超级赛日本站女单冠军

2010年国际羽联超级赛瑞士站女单亚军

2009年中国羽毛球公开赛女单冠军

2009年澳门羽毛球大奖赛女单亚军

2009年香港羽毛球公开赛女单亚军

2009年瑞士羽毛球公开赛女单亚军

2008年中国羽毛球公开赛女单冠军

2008年蝉联亚洲羽毛球锦标赛女单冠军

2007年亚洲羽毛球锦标赛女单冠军

2007年丹麦羽毛球公开赛女单冠军

2006年尤伯杯冠军成员

2005年全运会女单冠军

2003年世界青年锦标赛女单冠军

2002年荷兰青年公开赛单打冠军

2002年亚洲青年锦标赛单打冠军

2011年1月13日，世界羽联公布了最新一期世界排名，女单方面世界排名第7名。

羽联女单最新一期世界排名：6（截止2011年2月10日）

世界羽联最新一期女单世界排名：第5名。（截止到2011年3月17日）

世界羽联最新一期女单世界排名：第8名。（截止到2011年3月24日）

世界羽联最新一期女单世界排名：第6名。（截止到2011年4月21日）

世界羽联女单世界排名：第5名（截止2011年5月12日）

世界羽联最新一期女单世界排名：第6名。（截止到2011年6月2日）

世界羽联最新一期女单世界排名：第5名。（截止到2011年6月16日）

北京时间2013年8月6日广州羽毛球世锦赛进入第二比赛日，在女子单打首轮比赛的争夺中，前16号种子轮空直接晋级次轮；首轮焦点战——中国名将蒋燕皎对阵乌克兰选手尤里蒂娜，最终蒋燕皎赛前因腰伤选择退赛，尤里蒂娜不战而胜，晋级第二轮。

蒋燕皎昨晚腰部突然受伤，只能遗憾选择退赛。尽管此前身上有不少伤病，但蒋燕皎表示自己从未有过腰伤。据她本人透露，昨晚准备上床睡觉时，往下坐就感觉不舒服，有点疼，也没在意，直到今天越来越疼，可能腰部有点错位了。这也可能是导致蒋燕皎腰部受伤的原因。而无缘女单第二轮的比赛，也意味着蒋燕皎无法与队友奥运冠军李雪芮上演一场女单德比战。她的对手乌克兰选手尤里蒂娜不战而胜，晋级女单第二轮。