1218年春，蒙古使团来到花剌子模，并转达成吉思汗的话说：“我知君势之强，君国之大。我知君统治大地之一广土，我深愿与君修好。我之视君，犹爱子也。君当知我已征服中国，服属此国北方之诸突厥民族。君应知我国战士如蚁之众，财富如银矿之丰，实无须觊觎他人领土。所冀彼此臣民之间，得以互市，则为利想正同也。”成吉思汗的这番话语引起了摩诃末的不快和不安。他认为成吉思汗称他为儿子，是把他当附庸看待。

此后，摩诃末单独召见了使者马哈木，想进一步了解大蒙古国的情况。他将自己佩带的宝石赏给马哈木，希望他讲实话，并充当花剌子模的间细。他问马哈木道：“成吉思汗征服桃花石（即中国北部）。信否？……兵力几何？”马哈木为了照顾摩诃末的情绪，回答说，与花剌子模算端的军队相比，成吉思汗的军队只是九牛一毛而已。这样，摩诃末稍微平静下来，同意与蒙古人签订和约。马哈木不辱使命。后来，他以“牙老瓦赤”为名替蒙古帝国管理财政。

1216年，花剌子模军与蒙古军发生了一次小规模的冲突。速不台、脱忽察儿率军越过也儿的石河（额尔齐斯河）向西追杀蔑儿乞人，当蔑儿乞人逃到垂河（楚河）流域时，蒙古军前锋尾随而至。在速不台的一路追杀下，蔑儿乞人再逃到康里人居地。摩诃末在获悉这一消息以后，率军取道不花剌，进向毡的，准备趁火打劫。途中得知有一支蒙古军正在追击蔑儿乞人，于是返回撒麻耳干，再集结60000人马返回毡的城北，追随蒙古军与蔑儿乞人的踪迹。

这支蒙古军正是速不台追击蔑儿乞的那支，术赤在征服吉利吉思后，与速不台合兵，成为这支为数仅20000余的军队统帅而让速不台辅佐。摩诃末得知蒙古军在外尚未返回，便去偷袭蒙古军营地的妇孺，带走了一切战利品。术赤在回师的途中得知此事，快马加鞭回到营地。术赤向摩诃末解释来意，希望不要因误解引起双方的冲突，但摩诃末不听解释，他率军袭击了蒙古军。在此冲突中，摩诃末本人险些被俘，幸亏其子札兰丁的救援才得以脱险，当晚无心作战的蒙古军点燃营火，借此为掩护安然东返，此战中花剌子模军损失20000余人。1218年，在蒙古大将哲别灭亡西辽，杀死屈出律之时，花剌子模又抢先占领了西辽属地上的一些据点。初期的这些冲突为两国之间的战争埋下了隐患。

战争的导火线是蒙古商队被劫事件。1218年，成吉思汗根据蒙古和花剌子模两国达成的通商协议，派出由450人组成的大商队，用500峰骆驼驮着金、银、丝绸、驼毛织品、海狸皮、貂皮等贵重商品，带着成吉思汗给花剌子模沙的信前往花剌子模。成吉思汗在信中写道：“吾人应使常行的和荒废的道路平安开放，因之商人们可以安全地和无约束地来往”。

商队行至锡尔河上游的讹答剌城后，因守将亦纳勒出黑（号海儿汗）贪财，将商队扣留，并派人报摩诃末说，商队中有成吉思汗的密探。摩诃末在没有弄清事情真相的情况下，便下令处决商队成员，并没收其全部财物。亦纳勒出黑遵照摩诃末的命令，杀害蒙古商队成员，其中只有一人从牢里逃出，得以幸免，向成吉思汗报告了商队被害经过。

成吉思汗发誓要为死者报仇。据传说，成吉思汗闻报，“惊怒而泣，登一山巅，免冠，解带置项后，跪地求天，助其复仇，断食祈祷三日夜始下山”。但他还是希望双方能够通过和平方式解决争端，于是，派以巴合剌为首的3名使者前往花剌子模索取肇事者。使者向摩诃末国王转达了成吉思汗的原话：君前与我约，保不虐待此国任何商人。今遽违约，枉为一国之主。若讹答剌虐杀商人之事，果非君命，则请以守将付我，听我惩罚，否则即备战。摩诃末对此置若罔闻，不仅杀害了巴合剌，而且将两名副使的胡子剃光赶回。这些不足取的作法是产生事端，引起恶感及仇报、猛袭的原因，使和平安宁遭到破坏。

战前部署

过往的史书大都说摩诃末在这次战役中胆小如鼠，但实际上他的错误更多在于不明敌情。摩诃末判断蒙古军远涉数千里而来，跋涉于丛山峻岭与荒漠地区，一定人马疲乏，因此分别加强锡尔河沿岸各城的防御，使这些城市能够持久抵抗，以阻挡敌人前进：因为不清楚蒙古军会从何处攻入，就避免与蒙古人决战以分散他们的力量；他自己则在撒麻耳干征集军队，打算待敌人攻城顿挫，兵力耗竭的时候，找时机转取攻势。依照正规战法，他的构想是不错的，可惜他对于蒙古军的装备及成吉思汗的惯用战法毫无所知。成吉思汗在金朝作战近十年，将掳掠的工匠编成几个工兵集团，拥有较强的架桥修路与攻城能力。而成吉思汗的惯用战法，则是以一部兵力，围攻或监视当面敌人的城塞，主力则迂回深入敌人后方，迫使敌人于不预期的时间与地点，在不利的态势之下，仓皇应战，从而一举歼灭敌人的主力。

而且为了瓦解花剌子模的力量，成吉思汗还采取了其它反间措施：先是采纳突厥地区投降者的计谋，假托花剌子模太后秃儿罕亲戚之名向成吉思汗联名写信表示要按其意愿行事。而后，这封伪造信件通过投奔蒙古的一名近人呈给摩诃末。后是在1219年与1220年之交，派信使到花剌子模旧都玉龙杰赤（今土库曼斯坦乌尔根奇）告诉秃儿罕太后自己不是同她打仗，而是同她的儿子打仗，建议她缔结和约，并许诺将花剌子模和呼罗珊交由她统治，秃儿罕虽然置之不答，但玉龙杰赤方面，亦未曾出兵，自背后攻击成吉思汗。

在主力部队出征之前，成吉思汗派一支部队在费尔干纳一带进行佯攻，以转移摩诃末的注意力。1218年冬季，这支25000骑兵组成的部队由成吉思汗长子术赤和大将哲别率领，从喀什噶尔出发，从克基尔阿尔多和铁列古达坂两条山路翻越海拔4000米—7000米的冰山雪岭，进入阿赖岭北麓。1219年夏，抵达费尔干纳。摩诃末在得知术赤和哲别部队的动向以后，将锡尔河沿岸防线的主力部队调往费尔干纳方向，造成了主力分散的战略失误，成吉思汗声东击西的战略部署获得成功。

正当摩诃末在撒麻耳干城加固城墙、修筑堡垒时，在费尔干纳佯攻的蒙古军兵分两路，一路由术赤率领赶往讹答剌城与成吉思汗大军会合；一路由哲别率领5000骑兵，从锡尔河上游南下袭扰阿姆河上游地区。摩诃末认为，蒙古军如果占领了阿姆河流域诸城，将切断河中地区与阿富汗和呼罗珊的联系，于是，他派出主力部队前往阿姆河流域诸城增援。

1219年6月，成吉思汗带着次子察合台、三子窝阔台、四子拖雷，以及大将速不台、大断事官失吉忽秃忽等人率主力出征。他们从蒙古高原的克鲁伦河畔出发，越过阿尔泰山，到达也儿的石河畔，在这里休养兵马，直到秋高马肥之时，大军才继续西行到巴尔喀什湖的七河流域，再往西抵达锡尔河右岸。

1219年秋，大军经别失八里、不剌（今新疆博乐），通过铁木儿忏察（亦称松关，今新疆赛里木湖以南果子沟）至阿力麻里，然后，渡伊犁河，经海押立向花剌子模挺进。当时，铁木儿忏察是非常难行的隘口。1222年丘处机去西域见成吉思汗时也通过该隘口，他的随徒李志常在《长春真人西游记》里写道：千岩万壑攒深溪，溪边乱石当道卧，古今不许通轮蹄。蒙古大军通过时，成吉思汗次子察合台理石开道，并且砍木修桥，共修筑48座。桥的宽度，可容两辆车并行。途中，原来归顺蒙古人的畏兀儿亦都护巴尔术、海押立统治者阿儿思兰汗和阿力麻里统治者昔格纳黑的斤也率部加入了蒙古军。蒙古大军总人数到达10—15万。蒙古军于1219年秋末，在讹答剌城下屯兵。

蒙古军在讹答剌城下会合之时，成吉思汗兵分四路攻打中亚的一些主要城市：

1.由察合台（8000人）、窝阔台（5000人）率领的第一路军留在讹答剌城下攻城；

2.由术赤率领10000畏兀儿人组成第二路军北上攻锡尔河下游的毡的和养吉干；

3.由阿剌黑、速格秃、脱海三将领率领第三路军5000人南下攻锡尔河上游的费纳客忒（又称别纳客忒）和忽毡城（Khujand）；

4.成吉思汗与幼子拖雷率50000主力军渡锡尔河，直逼不花剌城。

成吉思汗不直接进攻离锡尔河较近的撒麻耳干，而是进攻在撒麻耳干城以西的不花剌，一是为了避重就轻，当成吉思汗抵达讹答剌之时，撒麻耳干已经加固，并有重兵守卫；二是在撒麻耳干守军固守城池、不敢出城迎战的情况下，蒙古军可以乘机长驱直入，攻入腹地，然后，发挥蒙古人擅长迂回包抄、聚而歼之的战术优势。

讹答剌之战

第一路蒙古军于1219年9月开始攻打讹答剌，他们奉命要活捉讹答剌血案的肇事者海儿汗。摩诃末曾给海儿汗50000人，后又派哈剌察领兵10000增援。海儿汗认为该城坚固，守军粮食充足，所以拼死守城。讹答剌被围5个月，军民士气受挫，城内发生矛盾，增援部队首领哈剌察认为投降为上策，而海儿汗坚持抵抗。于是，哈剌察率部出城逃亡，蒙古军顺势入城，占领了讹答剌外城，俘杀了哈剌察及其部下。蒙古军将讹答剌外城居民驱赶出城，纵兵劫掠。海儿汗率20000士兵退保子城（内城），又坚持抵抗了一个月，战到只剩下他和两个部下，最终被俘。讹答剌子城和城池被夷为平地，蒙古军掳掠居民和工匠充当“哈沙儿”（阿拉伯语，即签军。蒙古人将被征服地区的俘虏或居民组织成军队，作为先头部队掩护蒙古军），驱赶他们到撒麻耳干去作战。成吉思汗在夺取撒麻耳干以后，海儿汗被带到撒麻耳干城。为了给蒙古商人和使者报仇，成吉思汗命令将熔化的银液灌入他的耳朵和眼睛。

进军锡尔河下游

由术赤率领的第二路军首先来到锡尔河畔的昔格纳黑（Sïgnak）。术赤派穆斯林哈散哈只为使者，前去劝降。哈散哈只还没来得及劝降，就被一伙狂热的穆斯林杀死。于是蒙古军昼夜不停地攻打七天破城，为了给哈散哈只报仇，在城内进行了大屠杀。之后，术赤留下哈散哈只之子统治该城，大军继续沿河攻取锡尔河下游沿岸城市，直逼毡的。毡的守将渡锡尔河逃到花剌子模绿洲。术赤派使者成帖木儿到毡的城去劝降，成帖木儿以昔格纳黑的教训劝说居民。1220年4月，术赤领兵至毡的城，居民们没有做任何战斗准备，蒙古军“树梯环登”爬入城内，打开城门，由于没有遭到抵抗，只是杀死了几个辱骂成帖木儿的人，赦免了该城居民。他们把居民赶到野外，然后掠城九天。术赤将原来出使过花剌子模的不花剌人阿里火者留在毡的城统治。然后，术赤攻取了养吉干（卡扎林斯克南部），在此也派驻了蒙古官员。此后，术赤准许10000多从军西征的畏兀儿人返回故地，另外招募了10000突厥游牧民补充兵源。这些突厥人在攻打花剌子模的途中兵变，一些人遭到镇压，一些人逃往阿姆河以西的马鲁和阿母牙两城，在此集结以对抗蒙古军。术赤在占领锡尔河下游之后进军钦察草原，以后，他参加了蒙古军夺取花剌子模绿洲的战争。

攻克锡尔河上游

由阿剌黑、速格秃、脱海三人率领的第三路军按指示夺取锡尔河上游的费纳客忒，城主亦列惕古灭里带着他手下的突厥族康里人与蒙古军大战三日，第四天乞降，蒙古军将该城军民驱赶出城，士兵全部被屠杀，居民被分配给蒙古人做奴隶，工匠随军征战，壮丁被编入哈沙儿，参与攻打中亚的其他城市。此后，这支蒙古军回到了当时正在攻打撒麻耳干的成吉思汗处，并与从讹答剌前来的第一路蒙古军以及从不花剌、撒马耳干等各地抽调的队伍一起被派去忽毡。忽毡守将帖木儿灭里是花剌子模大将，骁勇善战，但他所部只有精兵数千，便退守锡尔河河洲上的己设堡垒，两岸矢石不能及。于是，蒙古军将从各城俘虏的50000哈沙儿集中，和20000蒙古军一起从山上运石头填河。帖木儿灭里知不能久守，率领着70艘船带着将士及其辎重在夜里顺流而下，向北逃走。中途被阻于蒙古军所架浮桥，在巴耳赤邗弃船登陆。蒙古军跟踪而至，紧追不舍，帖木儿灭里士卒死亡殆尽，仅单骑逃走，手中只剩下三支箭，这时被三个蒙古人追上，便射瞎了一个蒙古人的眼睛，吓跑了另外两个，他抵达了花剌子模，组织军队突袭养吉干，杀死了一位蒙古长官。后来成为一位苏菲教徒，多年之后回到忽毡时被当初射瞎一只眼的蒙古人认出，不屈被杀。

奇袭不花剌

成吉思汗及拖雷率领的第四路军从讹答剌城向不花剌进军，来到匝儿讷黑城时，城民躲进城堡中。成吉思汗派使者答石蛮哈只不前去劝降。一些居民想杀死他，他高声喊：“我奉成吉思汗令出必行的诏命，出使见你们，把你们从毁灭的深渊和血河中拯救出来。……若你们有丝毫反抗，一个时刻内，你们的城池将被夷为平地，原野将成血海。可是，若你们用明智、持重之耳，听从忠言和劝告，而且恭顺地服从他的指令，那么，你们的生命财产将固若金汤。”于是，城民派代表带着礼物来到成吉思汗营地，得到了赦免和善待。蒙古人进城以后，命令居民出城，将壮丁编为哈沙儿，与蒙古人一道前往攻打不花剌城，其他居民被遣回。蒙古人将匝儿讷黑城命名为忽都鲁八里，意为“幸福之城”。

在进军不花剌城的途中，当地一位突厥人建议走捷径，穿越被认为难以逾越的克孜勒库姆沙漠，经讷儿镇到不花剌，这条捷径以后被称为“汗路”。先到讷儿镇的前锋传达了成吉思汗大军到来的消息，讷儿镇居民派代表向成吉思汗表示降服并献上礼物。速不台进入讷儿镇以后，下令居民出城，然后纵兵劫掠了该城。讷儿镇居民派出60名壮士随该城长官之子亦勒火者前往不花剌和撒麻耳干两城之间的答不思协助蒙古军攻城。

1220年2月，成吉思汗大军抵达不花剌，在城下扎营。城内有守军突厥骑兵20000人，守城将领阔克汗在第三天拂晓之时带着守军和大多数城民弃城而逃，蒙古军在阿姆河畔追上并将他们全部杀掉。第二天早上，城内教长、士绅出城请降。成吉思汗骑马进入不花剌外城。他在经过礼拜五清真寺时，骑马进入清真寺。成吉思汗问道：“这里是算端的宫院吗？”有人回答说：“这是主的庙宇！”成吉思汗在祭坛前下马，登上祭坛，大声说：“原野上没有草了，将我们的马喂饱吧！”

蒙古军打开城内的所有粮仓，搬出谷物，把装《古兰经》的箱子作马槽喂马，《古兰经》散落地上任马践踏。蒙古军在清真寺里饮酒，强迫城中的歌姬给他们唱歌跳舞。城中的教长、贵族、法师和学者像奴隶一样为蒙古军照看马匹。成吉思汗把全城居民叫到城外公共祈祷的广场上，对他们做了演讲。他讲到了摩诃末背信弃义的行为，他说：“人们啊，须知你们犯了大罪，而且你们当中的大人物犯下这些罪行。如果你们问我，我说这话有何证明，那我说，这因我是上帝之鞭的缘故。你们如不曾犯下大罪，上帝就不会把我作为惩罚施降给你们。”讲话结束以后，他命令该城的富人交出他们的藏金。然后，成吉思汗下令焚烧城内的大部分房屋，只剩下礼拜五清真寺和几座宫殿。

在外城被攻破时，有一部分花剌子模兵退守内城，蒙古军逼不花剌人攻打内城。《多桑蒙古史》说内城守军只有400骑，殊不合理。内城很大，在蒙古炮兵集中射击之下，400骑决不能抵抗十二日之久。蒙古军使用投石器和弓箭，内城守军用弩炮和火油桶，厮杀十二天之后，蒙古军攻破内城，杀了30000多人。壮丁被征为哈沙儿，随蒙古人出征撒麻耳干和答不思。在攻陷撒麻耳干城以后，成吉思汗派塔兀沙担任不花剌的镇守官。不花剌的沦陷完全切断了花剌子模新都撒麻耳干和旧都玉龙杰赤之间的交通，意味着花剌子模的锡尔河防线变得毫无意义，整个河中腹地都暴露在蒙古大军的铁蹄之下。

撒麻耳干的陷落

攻克不花剌之后，成吉思汗率军向花剌子模都城撒麻耳干出发，沿途村落，只要不抵抗的都没有遭到洗劫。撒麻耳干守将为秃儿罕太后之兄弟秃海汗。早在成吉思汗到达讹答剌之时，撒麻耳干就已经整顿防务，加固城墙。

1220年5月，成吉思汗兵临撒麻耳干。发现大事不妙的摩诃末率领自己的古拉姆奴隶出逃。一连两天蒙古军没有攻城，成吉思汗亲自在城周围察看地形。在得知摩诃末已经南逃后，成吉思汗派哲别、速不台与脱忽察儿各将万骑（共30000人）南下追击，途中不扰和平军民也不围攻城镇，全力追捕摩诃末；同时还派遣阿剌黑那颜和牙撒兀儿进向瓦黑失（镬沙）和塔里寒。此时，攻打讹答剌的察合台、窝阔台也率军赶来与主力会合，随军还带来了许多哈沙儿。成吉思汗大军屯于城周围。蒙古军将哈沙儿每10人组成一队，各执一旗，城中守军误以为蒙古军队人数众多。

第三天蒙古军开始攻城，城内守军出动5000名塔吉克步骑兵配合，背靠城墙向成吉思汗发起挑战。蒙古骑兵则如同自己的西夏和金国所做的那样，以边打边撤的方式离开原地，将塔吉克人吸引到郊外。随着大量伏兵从四周策马环攻，这支出城的守军被屠杀殆尽。

第四天，成吉思汗亲自上阵，守军驱使大象出城作战，蒙古军打乱了他们的步兵阵容，负伤的大象在掉头返回之时踩死了自己的一些士兵，守军败回城中，士气大减，30000突厥—康里将士出城投降。

第五天，当成吉思汗正准备与守军进行决战之时，撒麻耳干城法官、教长等人前来乞降，他们打开城门，蒙古军进城后毁掉城墙和堡垒，并把城内居民驱赶到城外。蒙古军在城内进行了抢掠，城中藏匿之人尽被杀戮。成吉思汗下令放掉大象，让它们自己去找食，结果大象全被饿死。

第六天早晨，蒙古军攻入内堡，双方均使用火油桶激战，礼拜五清真寺被大火烧成灰烬，撒麻耳干城受到很大破坏。成吉思汗把该城的30000工匠分给他的儿子和族人，又将30000壮丁编入哈沙儿，其他居民在缴纳了20万迪纳尔的赎金以后被释放。契丹人耶律阿海和其他几个人被委任为该城的监国。期间出逃的摩诃末曾几次率军反扑，先后派出为数10000和20000骑的援军，皆遭失败。

占领玉龙杰赤

撒麻耳干被攻陷之后，1220年夏天，成吉思汗与拖雷移师至撒麻耳干西南的那黑沙不（今乌兹别克斯坦的卡尔施）附近草原休整。1220年秋，成吉思汗带着拖雷离开撒麻耳干，经过碣石、铁门关进抵忒耳迷，成吉思汗派拖雷率精锐部队进军呼罗珊；派察合台、窝阔台率大军向花剌子模绿洲进军，与从钦察草原南下的术赤一起攻打玉龙杰赤。

玉龙杰赤是花剌子模国旧都，城内居民很多。摩诃末退守南部以后，该城由秃儿罕太后管辖。在获悉蒙古军攻陷不花剌等城之后，她带着摩诃末的嫔妃和年幼的儿子们弃城向西逃到祃桚答而（今伊朗马赞达兰省）的一座位于高地的堡垒。于是，玉龙杰赤城民推举忽马儿的斤暂时为该城主。

1220年7月，蒙古人屯兵于玉龙杰赤城周围。他们先派小股蒙古骑兵逼近城门，驱掠牲畜。守军轻率地出城追击蒙古骑兵，蒙古骑兵将守军诱入埋伏圈，在离城不远名叫巴黑亦忽剌木的地方厮杀至黄昏，杀死1000多人。第二天，蒙古大军将城团团围住，由于城外没有石头，投石机只能向城内投掷桑木。蒙古军强攻入城，用火油桶焚烧房屋。在城内，双方短兵相接，在夺取阿姆河河上的一座桥梁时，3000名蒙古军被围歼，城内守军士气大振。由于术赤、察合台性格各异，素来不和，再加上成吉思汗已经将花剌子模封给了术赤，术赤不愿意破坏这座城市。在这种情况下，蒙古军号令不一、各执己见，造成军队纪律松散，伤亡巨大，攻城受阻，历时七个月还没能夺取该城。

成吉思汗在得知此事后非常生气，改命窝阔台统领攻城之事。窝阔台使两位兄长和解，并严整军纪，恢复了军队的战斗力。蒙古军与守城军民展开巷战，七日之后终于夺取该城。蒙古军将居民驱赶出城，将10万多名工匠送往蒙古，掠其妇女和幼童当作奴婢，其他人分配给蒙古军屠杀。屠城之后，蒙古军又掘开阿姆河堤坝，引水灌城，玉龙杰赤城淹没在一片汪洋之中，城中藏匿的人全部被淹死。

躲藏到祃桚答而堡垒里的秃儿罕随即被蒙古人围困长达四个月，最终因为缺水于1220年夏季投降，摩诃末诸幼子全被杀死，秃儿罕被带往蒙古，1233年病死。

玉龙杰赤城的陷落标志着中亚河中地区被蒙古人征服，称霸一时的花剌子模经过两年的较量，最终被蒙古人灭亡。

毁灭呼罗珊

当蒙古人灭西辽和花剌子模时，中亚西部的呼罗珊和南部的阿富汗部分地区还是花剌子模的属地，由帝国的地方官员统治着，其中，呼罗珊马鲁城的都督阿明灭里是秃儿罕的侄儿。在花剌子模统治中心河中地区还未陷落之时，摩诃末带着几个儿子向中亚西部逃亡。于是，两批蒙古军在大将哲别和王子拖雷的率领下，先后追到呼罗珊，征服了马鲁、你沙不儿（今伊朗尼沙普尔）和也里（今阿富汗赫拉特）。

摩诃末一行来到马鲁城，在对该城军民下达的命令中说在蒙古人来到之时，官员们可以退守马儿哈堡，城民们可以投降。马鲁城长官巴哈木勒克在蒙古人来到之前，就领着马鲁城贵族退守马儿哈堡，以后又退到塔黑亦牙即儿堡。当时，城内除了本地居民外，还有被蒙古人打败之后逃难至此的毡的城民，以及因兵变从蒙古军叛逃的突厥人。他们由马鲁前任长官抹智儿木勒克率领，在马鲁城组织抵抗。1220年5月，追击摩诃末的第一批蒙古军在哲别和脱忽察儿的率领下来到呼罗珊，巴哈木勒克从塔黑亦牙即儿堡又逃到祃桚答而，他向蒙古人表示，愿作为蒙古军的使者前往马鲁城劝降，7名蒙古人随他来到马鲁城，抹智儿木勒克将他们全部杀死。

1220年秋，成吉思汗又派拖雷率精锐部队协助哲别。拖雷军在逼近时先派400名骑兵为先锋于夜晚抵达城外的河岸，袭击了驻守河岸的12000名突厥骑兵，缴获了6万头牲畜和其他财物。1221年2月5日，拖雷率军抵达马鲁城下，在六天中，观察了马鲁所处的地形，研究了对策。第七天，蒙古军把马鲁城团团围住。第八天，抹智儿木勒克派使者到拖雷军营乞降。拖雷率军入城，将城内富豪大户的钱财全部没收，留下400名工匠和一些童男童女为奴，其余的人全部杀掉。藏匿在城内的人出来以后，也被殿后的蒙古军以送谷物到郊外为名集中杀死。

与哲别一起来到呼罗珊的蒙古将领脱忽察儿因违令侵扰已经归顺的马鲁城都督阿明灭里，被成吉思汗调到拖雷军中。拖雷在攻马鲁城期间，派脱忽察儿为前锋绕过马鲁城向西北去攻打奈撒。脱忽察儿到奈撒城下架炮攻城，半个月以后破城，因攻城时部将别勒忽失被射死而进行了大屠杀。1220年11月，脱忽察儿在围攻你沙不儿时被流矢射死。得知这一消息之后，拖雷从马鲁城赶往你沙不儿，于1221年春兵临城下。当时，摩诃末之子札兰丁也在你沙不儿城，在获悉蒙古军逼近之后，他向也里城逃去。你沙不儿城民派使者到拖雷营中乞降遭拒。经过四天的激战，1221年4月10日，你沙不儿城陷，脱忽察儿的妻子主持了屠城，城市被夷为平地，全城居民被杀死，首级割下来按男、女、小孩分别堆成金字塔形。

此后，拖雷追逐札兰丁来到了也里城，札兰丁逃向哥疾宁（今阿富汗加兹尼），把也里留给部下镇守。镇守官兵们坚守拒降，拖雷一连攻打了八天，直到守城长官战死，城民才开城乞降。拖雷杀了12000名花剌子模士兵，其余的全部赦免。此时，拖雷接到成吉思汗的命令，要他率军返回，协助攻打塔里寒。于是，他离开了也里城前往塔里寒。

征服阿富汗

在派拖雷攻打呼罗珊后，成吉思汗本人于1220年秋开始围攻阿姆河北岸的忒耳迷（今乌兹别克斯坦帖尔穆兹）。居民拒不投降，成吉思汗围攻11天攻克该城。城陷之后，蒙古军把居民赶到城外，全部杀死。接着，成吉思汗从忒耳迷朝东北方向进军，在康格儿忒（今塔吉克斯坦库良布省康古尔特村）和薛蛮（今塔吉克斯坦杜尚别）两地过冬。在此，一支蒙古军在巴达哈伤劫掠。1221年初，成吉思汗率军南渡阿姆河，来到呼罗珊的重要城市巴里黑。巴里黑城民派使者带着贡品和礼物乞降，蒙古军以清点人口为借口，将居民驱逐到城郊后全部杀死，蒙古军入城纵掠，然后放火烧毁了这座城市。此后，成吉思汗西进至塔里寒的讷思来忒忽堡。此处海拔高，投射物难以达到，加上城堡坚固，守军勇猛，一时间难以攻下。蒙古军派使者前去诱降，未果。成吉思汗此时得知了札兰丁复兴的信息，留下一部兵力攻城，自己向东南前往哥疾宁，途中，由于古儿疾汪（今阿富汗古尔吉万县）城民的抵抗，蒙古军花了一个月时间攻下该城。然后，蒙古军越过兴都库什山抵达范延（今阿富汗巴米扬），在此，蒙古人也遭到了当地居民的抵抗，双方都使用弓矢弩炮，成吉思汗宠爱的孙子（察合台之子）木阿秃干中箭身亡。成吉思汗在攻下范延城将其夷为平地，改名为“卯危八里”，波斯语意为“歹城”。

此时在讷思来忒忽堡的蒙古军围困了六个月仍一无所获，因此成吉思汗返回塔里寒，并把派往呼罗珊的拖雷军调回。在拖雷还未赶到塔里寒之时，成吉思汗命令蒙古军在城外建木架、运土石，建造了一个与讷思来忒忽堡一样高的土丘。蒙古军在土丘上架设大炮向城堡内炮轰，守城军士在炮轰下突围，一小部分得以逃生。在拖雷到达之时，讷思来忒忽堡已被攻下，此地抵抗蒙古军长达七个月。与此同时，攻下玉龙杰赤的察合台和窝阔台也赶来，全军在塔里寒山间度过了1221年的夏天。长子术赤在攻克玉龙杰赤以后，则回到了额尔齐斯河其辎重所在的营地了。

负责追击摩诃末的蒙古军在哲别和速不台的带领下后来进行了一次空前的大远征。他们越过高加索山脉进入南俄，在迦勒迦河打败80000俄罗斯联军。然后向东渡过伏尔加河，经哈萨克斯坦返回，于1224年与成吉思汗大军相会。

八鲁湾之战

此后，蒙古军与花剌子模军的战争主要发生在中亚南部的阿富汗。在塔里寒休整期间，成吉思汗获悉摩诃末之子札兰丁已经逃到哥疾宁城的消息，于是在自己率军经古儿疾汪南下的同时，派失吉忽秃忽、帖客扯克、木勒合儿等人为先锋，率军30000火速前往哥疾宁。

札兰丁是摩诃末的长子，也是诸子中最英勇者。1215年，摩诃末攻下哥疾宁城以后，曾任命札兰丁驻守，可以说，哥疾宁是札兰丁的封地。蒙古军兵临撒麻耳干时，札兰丁与父亲退到巴里黑，最后与其父一起西逃到里海的一个岛上。1220年末，摩诃末病逝，临死之前指定札兰丁为王位继承人。札兰丁及兄弟兀思剌黑和阿黑在岛上安葬了父亲，然后取道曼吉什拉克返回玉龙杰赤。该城的统治者们不希望札兰丁回来，阴谋杀害他，于是，札兰丁于1221年2月10日逃离玉龙杰赤城，来到你沙不儿城，以后又逃到也里，在拖雷攻也里之时，他辗转来到哥疾宁，在此开始招集散亡的旧部。突厥蛮首领赛甫丁·阿格剌黑率40000军队前来投奔，乌古思首领也率部来投，一时间，札兰丁在哥疾宁城集结了数万军队。

当札兰丁在哥疾宁城集结军队之时，马鲁城都督阿明灭里与之联系，两人约定在八鲁湾集结。1221年春，札兰丁的军队前往八鲁湾，途中，札兰丁袭击了围攻瓦里延堡的蒙古军，杀死1000多人。袭击成功之后，札兰丁的军队继续前往八鲁湾与阿明灭里的军队会合，人数达到60000之众。蒙古军在失吉忽秃忽等人的率领下也朝八鲁湾进发，双方在此进行了一场大战。

战争当天，双方一直厮杀到黄昏还难分胜负，暂时停战。第二天黎明，蒙古军在自己备用的马匹上设置假人，札兰丁的士兵们以为蒙古援军已到，军中一片恐慌，有人建议逃走，札兰丁却坚持战斗，最终击溃了蒙古军。由于原野上有许多坑洞，蒙古马跑不快，在札兰丁骑兵的追杀下，蒙古军死伤15000人。

1221年夏秋的八鲁湾之战是蒙古西征以来，花剌子模军队取得的一次最大胜利。受这一胜利的鼓舞，那些曾被蒙古军征服地区的居民开始起义反蒙，城市统治者起来杀死蒙古长官，恢复自己的统治。其中，也里、马鲁等城的反抗最为激烈，宴只吉带率领的蒙古军在围攻也里城数月之后，于1222年6月攻破该城，全城居民遭到屠杀，城市被焚毁。马鲁城也遭到了同样的命运。

申河之战

成吉思汗得知八鲁湾战败的消息以后，“怒而不形于色，仅语忽秃忽，谓其狃于常胜，未受挫折，今遭此败，当以为戒”。此后，他亲自率军50000火速南下，等赶到八鲁湾时，札兰丁的军队已经返回哥疾宁。八鲁湾胜利之后，札兰丁部队内部发生了冲突。阿明灭里和赛甫丁·阿格剌黑为一匹马发生争执，阿明灭里用鞭子打了阿格剌黑的头，札兰丁没有惩治阿明灭里，阿格剌黑一气之下率领自己的部队离开了札兰丁，前往白沙瓦。

成吉思汗在八鲁湾向部将们分析了失吉忽秃忽失败原因是没有选择有利地形，希望部将们引以为戒，然后率大军向哥疾宁进发，于1221年8—9月赶到，获得情报称札兰丁已经于两周前离开该地。札兰丁在获悉成吉思汗大军来临的消息以后，与阿明灭里的部队一起向申河（印度河）方向逃走。成吉思汗委任祃祃·牙老瓦赤统治哥疾宁，接着追赶札兰丁剩余的30000军队来到申河河畔，阿明灭里被杀，札兰丁被包围，全军覆没。在蒙古军步步紧逼，逐渐缩小包围圈之时，札兰丁跃马跳入申河，泅水而逃。成吉思汗没有射杀他，也没有继续追击，札兰丁英勇无畏的精神感动了成吉思汗，他赞叹道：“为父者应有这样的儿子！”

虽然札兰丁日后还在南方的旁遮普聚拢残部，并感召德里苏丹国派兵支援，却已经无法对大局产生撼动。

此后，成吉思汗率军沿申河北上，派窝阔台顺河南下，继续征服未归顺的地区。窝阔台率军来到哥疾宁城下，命令将居民赶出城外，除工匠外一律杀死，并摧毁了这个城市，撤离前留失吉忽秃忽在此城监管俘虏和工匠。据《史集》记载，窝阔台请求成吉思汗允许他去攻打阿富汗西面的昔思田（今伊朗东部锡斯坦省），后因天气炎热，成吉思汗命他回师，于是，窝阔台经阿富汗南部的该儿母西儿（在阿富汗南部希里明德河中游）返回。

当成吉思汗到达迦儿漫和桑忽兰之时，有消息说札兰丁重渡申河返回。1222年春，成吉思汗派八剌、朵儿拜二将搜索札兰丁。1222年夏，成吉思汗沿河而上避暑于八鲁湾草原，并在此等候八剌军的消息。八剌军在申河未见札兰丁的踪迹，他们就攻必牙堡（今巴基斯坦旁遮普省杰卢姆县），在此抢掠之后向木勒坛（今巴基斯坦木尔坦）进军，兵临木勒坛城下，由于天气炎热，士兵们中暑，蒙古人撤军。沿途对剌火儿（今巴基斯坦拉合尔）、富楼沙、灭里蒲儿等地进行了掠夺，然后渡过申河，经哥疾宁到八鲁湾草原与大军会师。沿申河征战的窝阔台也率军前来与大军会合。

由于出征四年多，加之西夏叛乱，1223年春，成吉思汗决定经印度、吐蕃回蒙古，后因山麓起伏，道路艰险，大军只得返回富楼沙，经原路返回。

1223年夏，大军越过范延山，驻扎在巴格兰。1223年秋，蒙古军经巴里黑渡阿姆河，北上不花剌城，东行至撒麻耳干。成吉思汗认为是上帝帮助他战胜了摩诃末，所以命令撒麻耳干穆斯林用他的名字祈祷，并豁免该城法官、教长的赋税。蒙古军在撒麻耳干度过了1223年的冬天。在此，成吉思汗命术赤从钦察草原带着猎物前来会面，术赤没有来，而是派人将猎物赶到豁兰八失（位于阿雷斯河和塔剌思河之间，从奇姆肯特到江布尔的中途），以供射猎之娱，并献马两万匹。1224年春天，成吉思汗召集诸子在锡尔河畔召开了忽里勒台。1224年夏，成吉思汗在豁兰八失度过。

蒙古帝国对中亚的初期治理

1225年2月，成吉思汗回到了蒙古草原土拉河行宫。成吉思汗占领花剌子模国后，命长子术赤镇守，并在各城设置达鲁花赤。达鲁花赤为蒙古帝国在占领区及重要城镇所设置的最大军政监治长官，负责监临占领区被委任的当地官员，位于占领区当地统治者之上，握有最终裁定权。乌尔根奇城的牙老瓦赤、马里忽惕（属忽鲁木石氏）父子二人向成吉思汗提出了管理城邑的办法，得到允准，遂派马思忽惕同达鲁花赤共同管理布哈拉、撒马尔罕、乌尔根奇等中亚城市，派牙老瓦赤管理中都（今北京）。

可以说，从1223年开始，蒙古人在河中与花剌子模的统治权已无人挑战。伊本·阿昔儿与志费尼都证明了如此事实：因为蒙古统治权的建立，河中地城邑较之呼罗珊、伊拉克诸城从蒙古人的破坏中恢复得更快、更多。

达鲁花赤的设置，既说明蒙古帝国对中亚地区的主权行使，也表明蒙古贵族在被征服的广袤土地上开始了一种新型的统治方式。这种统治方式以蒙古习惯法《札撒》为根本，结合占领地原有的统治惯例实行蒙古帝国对征服地的统治权，从而保障了蒙古大汗及贵族们的既得利益，一定程度上有利于被征服地区社会经济的恢复和发展，为蒙古帝国在西亚的统治提供了一个施政蓝本。

成吉思汗的一生是在戎马征战中度过的，在短短十几年中，蒙古人征服了中亚大部分地区，大蒙古国发展成为地域广大的大帝国。

成吉思汗第一次西征，其结果是消灭了花剌子模，征服了整个河中地区，同时袭扰了波斯东部、北部和西部等许多地方，无疑给中亚、西亚各族人民的生命财产造成了巨大的破坏，许多维系地区生产的水利设施被摧毁。但是，蒙古大军也消除了妨碍东西方交往的屏障，打通了业已闭塞的亚欧大陆通道，客观上促进了东西方物质文明和精神文明的交往，对世界历史的发展起到较大的促进作用。如李思纯所说：“蒙古西侵，乃将昔日阻塞未通之道途，尽开辟之，而使一切民族种姓，聚首相见。”蒙古第一次西征开始了游牧民族对农耕世界的第三次大冲击。

这次西征涉及范围之广、影响之大在世界历史上都实属罕见。在人类历史上意义非凡。西征的最后胜利证明了成吉思汗这一战略抉择的正确性。

蒙古第一次西征将中亚一切具有使用价值的人口作为“马背稍将来的人口”掳到中国。这些人口到中国后，就开始了一个新的民族过 程。经过蒙古帝国和元朝一百多年的统治，其中一部分散居于中国各地的中亚民族逐渐同化于中国各民族当中；另一部分聚居在中国西北的中亚民族形成了回族的主体。

在整个战争期间，极大的充实了蒙古国家和个人的财富，以及对蒙古军事技术、生产技术、社会管理和文化知识等方面的提高起了巨大的作用，为新的征服准备了雄厚的基础。元朝统治者尊重当地居民的风俗习惯，尤其对伊斯兰教徒施行宽容政策。经过20余年的治理，到13世纪60年代，中亚的州县社会经济恢复繁荣景象。但掠夺政策给中亚各国留下了无法弥补的巨创。

蒙古大军的准确人数争议较大，各记载中的数字各不相同，有时甚至带有幻想色彩，术兹札尼的《纳昔儿史话》说有80万人。这是因为蒙古军行军作战总是分成数个纵队广正面前进，每一纵队的活动地区也很广大；一次大军作战往往涵盖数百里之地。西方战败国家一听说处处受兵，纷纷告急，所以误以为蒙古军人数很多。到1219年时，成吉思汗拥有的军队已包括附庸的畏兀儿、哈剌鲁等军队在内，西征时畏兀儿军10000人，哈剌鲁6000人，以及由郭宝玉率领的一部分汉军。不过，相当一部分军队正在随着木华黎伐金，还有一部分一般说来当留在蒙古保护家园和畜群。考虑到这些情况，那么可以设想，进攻中亚的蒙古军队及其附庸军（包括畏兀儿、突厥、汉人军队）不会超过12万人，其中蒙古骑兵部队只有7万人。虽然如此，蒙古军每破一城，或每打一次胜仗，就掳民补充，到这次战役后期的人数，则无法估计。

整个花剌子模帝国理论上拥有40万大军。除了算端的直属部队，也包括各级封建制度下的地方武装。至于花剌子模算端分驻在各个城市的军队，仅撒麻耳干一城就大约有守军11万人，其中突厥人6万，波斯人5万，还有20头大象。但考虑到1217年冬摩诃末曾进军巴格达，因为冬季寒冷损失了40000军队，又在与术赤的交锋时损失了20000之众。再加上为了维持绝对控制而难以调动的地方军，估计花剌子模在河中作战的实有兵力不会超过20万。

波斯编年史叙述，在你沙不儿战役中，蒙古人屠杀的准确数字是一百七十四万七千人（174万7千人）。这一数字超过了也里城被杀的一百六十万（160万）。蒙古史学家术兹札尼声称也里城的死亡总数达到两百四十万（240万）。后来更多学者估计成吉思汗入侵中亚的五年中，死亡人数大约为一千五百万。然而，即便是这个比较适中的总数，也要求每个蒙古人要杀死一百多人；其他城市夸大的记录，则要求每位蒙古士兵要屠杀三百五十人。

1220年3月，不花刺居民则开城投降，而在内堡，成吉思汗则遭到算端守军的顽强抵抗，成吉思汗最终还是攻下了内堡，康里人全部被杀，他们的子女沦为奴婢。城内的居民被免死，而青壮年被强征入伍，随成吉思汗进兵撒麻耳干。战争三天，城里的居民打开了投降之门，而驻守在内堡的军队则继续战。成吉思汗攻克内堡，大约有三万多康里人和突厥人被杀，在花剌子模旧都玉龙赤杰他们同样遭到了当地居民的顽强抵抗。当蒙古人攻下该城后，进行了大屠杀，除了工匠和沦为奴婢的孩童和妇孺外，其余的人 则分给军队，让每名军士屠杀二十四人。最后引水淹城，一座闻名中亚的繁盛都城从此沦为沼泽。

1220年秋成吉思汗在巴里黑，因为不相信当地人的投降，而又进行了一次屠杀，塔里寒、古儿疾汪也遭受了同样的命运，只不过是当地居民对蒙古人进行了顽强的抵抗。而在范延，成吉思汗的爱孙察合台之子木阿秃干不幸身中流矢而亡，“成吉思汗下令把所有动物、从人类到牲口，杀个精光；不许留下俘虏，哪怕孕妇腹内的胎儿也不得饶过；今后不许动物居住这个地方”。

蒙古军队在1221年4月对尼沙普尔城的屠杀，使此城彻底被摧毁，“尸体被砍头，将首级按男、女、小孩分别堆成金字塔形”。又处死城内的猫、狗以及其他一切有生命的动物。

1221年春，拖雷攻下马鲁城后，除了工匠和一部分沦为奴婢的人外，其余所有居民不论男女老少统统被杀掉，城池则被夷平。而随后赶来的蒙古人又把这次刀下余生的居民残杀殆尽。在奈撒，脱察哈儿部将别勒忽失中流矢而死，脱察哈儿猛攻该城15日，攻下该城后，“蒙古兵不分男女老幼，攒射屠之。死者或为奈撒居民，或为他处人民来此避难者，计共有七万人”。

《史集》载呼罗珊和阿只迷两地幸存者不足千分之一，昔日十万人口地方幸存者不满百人。

蒙古军入撒马尔干，屠杀三万投降将士。

成吉思汗西征采取了恐怖政策，屠杀与宣传并用。但波斯人和阿拉伯人的记载时有夸大之处。据《世界征服者史》记载，在蒙古人的治理下，到了1260年，不花剌和撒麻耳干等州县在某些方面已达到原来繁荣昌盛的水平，而在另一方面很接近原来的水平。

成吉思汗从动身西征起，便采用中原的交通制度，在通往西域的大道上，开辟“驿路”，设置“驿骑”、“铺牛”和“邮人”把中原旧有驿站系统延伸到西域。这一艰巨事业一直到他的子孙时代还继续进行改善和发展。西征时带去大批汉族技术人员，沿途辟山开路，修筑桥梁，改善东西交通条件，为了维持道路上的安全，他还特别在交通大道上设置护路卫士，颁布保护来往商人安全的扎撒（法令）。《突厥世系》著者花剌子模的阿不勒·噶齐（1606—1646）说：“在伊朗和突兰（今中亚）之间的一切地方享有这样一种安宁，头顶金盘，自东徂西，不会遭受任何人的侵犯”。这样东西畅通无阻的时代，古代史上曾出现过几次？成吉思汗把东西交通大道上的此疆彼界扫除了，把阻碍经济文化交流的堡垒削平了，于是东西方的交往开始频繁，距离开始缩短了。中国的创造发明如火药、纸币、驿站制度等输出到西方，西方的药物、织造品、天文历法等也输入了中国（韩儒林）。

成吉思汗西征花刺子模战争在中国战争史上占有重要地位，其特点为军事、政治、外交综合运用。成吉思汗的战略基本原则是：摧其坚、夺其魁，以解其体。在政治上，争取对方贵族、官吏、宗教领袖、军事首领等代表人物降服，在军事上，针对花剌子模分军防守要点的特点，采用迂回及突然袭击等战术，逐次占领对方战略要点，从而取得了第一次西征的胜利（战略网）。