蓝色星空BBS的最高管理机构为站务委员会。设站务总管1-3名，以及数量不等的常任站务、技术站务、发展站务、实习站务、美工站务和账号管理员等职位。站务总监全面领导包括重要职务任免、日常用户管理和讨论区管理等行政事务性工作。技术站务组长全面领导包括硬件维护、软件开发、日常维护在内的各方面技术工作。

站务委员会以下设有十一个分区，每个分区根据需要任命若干名区务（区管），具体管理各自区内讨论区的开设、下属版务的任免等日常事务，并经常巡查各讨论区的实际运作状况。每个讨论区一般任命有1～3名版务（版主），负责对治下的讨论区进行言论监督、讨论引导和精华区建设等日常工作。一般来说，版务对区务直接负责，区务则对站务委员会负责，但是俱乐部版面原则上实行版务自治，区长轻易不得干涉版务决策。