更新时间：2024-01-16 16:19
2014年在美国德克萨斯州大学西南医学中心(University of Texas Southwestern Medical Center)获得博士学位。2014年-2017年在美国麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)从事博士后研究工作。2017受聘于四川大学生物治疗国家重点实验室/华西第二医院，任研究员。
实验室主要研究方向
通过小鼠、人胚胎干细胞及诱导多功能干细胞体外定向分化为心脏谱系细胞的实验体系和小鼠体内遗传谱系示踪实验体系，发掘调控心脏发育的新作用因子及分子调控通路。在心脏发育过程中，心脏祖细胞在各种细胞因子、诱导信号及核心转录因子的精确调控下，最终分化为组成心脏的各种类型细胞。如果内在基因水平变异或外界发育环境变化影响了该过程中的任何环节，都可能造成先天性心脏发育不良。然而，目前我们对于该过程的认识还非常有限。这些研究将不仅有助于更深入了解心脏的发育及心脏疾病的发生发展过程，而且为先天性心脏病诊断治疗、药物干预新靶点的研究开辟新途径。近年来相关工作发表在Nature、Molecular Cell、Gene & Development、PLoS Genetics等国际知名杂志上。
1. 多能干细胞（胚胎干细胞和iPS）细胞命运决定的表观遗传学调控机制研究；
2. 调控心脏发育的长非编码RNA、RNA结合蛋白、转录因子及其分子作用机制；
3. 结合单细胞组学及遗传谱系示踪方法发掘胚胎发育早期心脏祖细胞的新亚群及其分子标记；
4. 心脏谱系细胞体外定向分化方法的探索与优化。
1. Xue, Z., Ye, Q., Anson, S.R., Yang, J., Xiao, G., Kowbel, D., Glass, N.L., Crosthwaite, S.K., and Liu, Y. (2014). Transcriptional interference by antisense RNA is required for circadian clock function. Nature 514, 650-653. (IF=40.1)
2. Xue, Z., Hennelly, S., Doyle, B., Gulati, A.A., Novikova, I.V., Sanbonmatsu, K.Y., and Boyer, L.A. (2016). A G-Rich Motif in the lncRNA Braveheart Interacts with a Zinc-Finger Transcription Factor to Specify the Cardiovascular Lineage. Mol Cell 64, 37-50. (Highlighted by Mol Cell, Nature Chemical Biology, and Science Signaling) (IF=14.7)
3. Xue, Z., Yuan, H., Guo, J., and Liu, Y. (2012). Reconstitution of an Argonaute-dependent small RNA biogenesis pathway reveals a handover mechanism involving the RNA exosome and the exonuclease QIP. Mol Cell 46, 299-310. (IF=14.7)
4. Lee, H.C.*, Li, L.*, Gu, W.*, Xue, Z., Crosthwaite, S.K., Pertsemlidis, A., Lewis, Z.A., Freitag, M., Selker, E.U., Mello, C.C., Liu, Y. (2010). Diverse pathways generate microRNA-like RNAs and Dicer-independent small interfering RNAs in fungi. Mol Cell 38, 803-814. (IF=14.7)
(5)Zhang, Z.*, Chang, S.S.*, Zhang, Z., Xue, Z., Zhang, H., Li, S., and Liu, Y. (2013). Homologous recombination as a mechanism to recognize repetitive DNA sequences in an RNAi pathway. Genes Dev 27, 145-150. (IF=10.0)
(6)Yang, Q., Li, L., Xue, Z., Ye, Q., Zhang, L., Li, S., and Liu, Y. (2013). Transcription of the major Neurospora crassa microRNA-like small RNAs relies on RNA polymerase III. PLoS Genet 9, e1003227. (IF=6.7)
(7)Dang, Y., Li, L., Guo, W., Xue, Z., and Liu, Y. (2013). Convergent transcription induces dynamic DNA methylation at disiRNA loci. PLoS Genet 9, e1003761. (IF=6.7)
(8)Dang, Y., Yang, Q., Xue, Z., and Liu, Y. (2011). RNA interference in fungi: pathways, functions, and applications. Eukaryot Cell 10, 1148-1155. (IF=3.4)