2023年12月4日，发起成立大流行病学研究联盟。

1997年H5N1禽流感在香港爆发期间，袁国勇最先在Lancet报道H5N1患者具有较严重的临床症状和高死亡率，而H5N1患者的样本可以在他的实验室通过自行研制的分子诊断方法进行快速检测。2003年SARS爆发期间，袁国勇及他领导的小组成员追查到SARS的病原冠状病毒，接着他又发现了SARS冠状类似病毒的自然宿主是中华菊头蝙蝠，并且提出由于蝙蝠携带有新型的病毒，是造成突发传染病的主要源头。他在发现新型微生物方面成就卓著，截至2019年3月已在人类和动物体内发现逾60种新型病毒、10种细菌、四种真菌及两种原虫。这些病毒包括蝙蝠冠状病毒HKU4、HKU5，是MERS冠状病毒的祖先。

经过多年的临床和实验室培训与实践，袁国勇在香港大学教学医院玛丽医院设立了结合临床和实验室针对传染病的服务，其中包括巨细胞病毒和结核病菌的快速分子诊断。

截至2019年3月，袁国勇已在Lancet、New England Journal of Medicine、Science、Journal of Virology and PNAS等国际期刊发表超过900篇学术论文，被引用超过36000次。2015年、2018年、2020年、2021年入选全球最广获征引研究人员。

代表性著作

VIRUS

Chen Y, Liang W, Yang S, Wu N, Gao H, Sheng J, Yao H, Wo J, Fang Q, Cui D, Li Y, Yao X, Zhang Y, Wu H, Zheng S, Diao H, Xia S, Zhang Y, Chan KH, Tsoi HW, Teng JL, Song W, Wang P, Lau SY, Zheng M, Chan JF, To KK, Chen H, Li L,Yuen KY. Human infections with the emerging avian influenza A H7N9 virus from wet market poultry: clinical analysis and characterisation of viral genome.Lancet. 2013 Jun 1;381(9881):1916-25.

Woo PC, Lau SK, Wong BH, Fan RY, Wong AY, Zhang AJ, Wu Y, Choi GK, Li KS, Hui J, Wang M, Zheng BJ, Chan KH,Yuen KY†. Feline morbillivirus, a previously undescribed paramyxovirus associated with tubulointerstitial nephritis in domestic cats.Proc Natl Acad Sci U S A.2012 Apr 3;109(14):5435-40.

Kao RY, Yang D, Lau LS, Tsui WH, Hu L, Dai J, Chan MP, Chan CM, Wang P, Zheng BJ, Sun J, Huang JD, Madar J, Chen G, Chen H, Guan Y,Yuen KY†. Identification of influenza A nucleoprotein as an antiviral target.Nat Biotechnol. 2010 Jun;28(6):600-5.

Zheng BJ, Chan KW, Lin YP, Zhao GY, Chan C, Zhang HJ, Chen HL, Wong SSY, Lau SKP, Woo PCY, Chan KH, Jin DY,Yuen KY†. Delayed antiviral plus immunomodulator treatment still reduces mortality in mice infected by high inoculum of influenza A/H5N1 virus.Proc Natl Acad Sci U S A.2008 Jun 10;105(23):8091-6.

Yuen KY*, Chan PK, Peiris M, Tsang DN, Que TL, Shortridge KF, Cheung PT, To WK, Ho ET, Sung R, Cheng AF. Clinical features and rapid viral diagnosis of human disease associated with avian influenza A H5N1 virus.Lancet. 1998 Feb 14;351(9101):467-71.

Beigel JH, Farrar J, Han AM, Hayden FG, Hyer R, de Jong MD, Lochindarat S, Nguyen TK, Nguyen TH, Tran TH, Nicoll A, Touch S,Yuen KY*. Avian influenza A (H5N1) infection in humans.N Engl J Med. 2005 Sep 29;353(13):1374-85. Review

Woo PC, Lau SK, Tsoi HW, Chan KH, Wong BH, Che XY, Tam VK, Tam SC, Cheng VC, Hung IF, Wong SS, Zheng BJ, Guan Y,Yuen KY*. Relative rates of non-pneumonic SARS coronavirus infection and SARS coronavirus pneumonia. Lancet. 2004 Mar 13;363(9412):841-5.

Peiris JS, Chu CM, Cheng VC, Chan KS, Hung IF, Poon LL, Law KI, Tang BS, Hon TY, Chan CS, Chan KH, Ng JS, Zheng BJ, Ng WL, Lai RW, Guan Y,Yuen KY*. Clinical progression and viral load in a community outbreak of coronavirus-associated SARS pneumonia: a prospective study.Lancet. 2003 May 24;361(9371):1767-72.

Peiris JS, Lai ST, Poon LL, Guan Y, Yam LY, Lim W, Nicholls J, Yee WK, Yan WW, Cheung MT, Cheng VC, Chan KH, Tsang DN, Yung RW, Ng TK,Yuen KY*. Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome.Lancet. 2003 Apr 19;361(9366):1319-25.

Lau SK, Woo PC, Li KS, Huang Y, Tsoi HW, Wong BH, Wong SS, Leung SY, Chan KH,Yuen KY*. Severe acute respiratory syndrome coronavirus-like virus in Chinese horseshoe bats.Proc Natl Acad Sci U S A.2005 Sep 27;102(39):14040-5.

Wong S, Lau S, Woo P,Yuen KY.* Bats as a continuing source of emerging infections in humans.Rev Med Virol. 2007 Mar-Apr;17(2):67-91. Review

Woo PC, Lau SK, Yip CC, Huang Y, Tsoi HW, Chan KH,Yuen KY*. Comparative analysis of 22 coronavirus HKU1 genomes reveals a novel genotype and evidence of natural recombination in coronavirus HKU1.J Virol. 2006 Jul;80(14):7136-45.

Woo PC, Lau SK, Chu CM, Chan KH, Tsoi HW, Huang Y, Wong BH, Poon RW, Cai JJ, Luk WK, Poon LL, Wong SS, Guan Y, Peiris JS,Yuen KY*. Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus, coronavirus HKU1, from patients with pneumonia.J Virol. 2005 Jan;79(2):884-95.

BACTERIA

Woo PC, Lau SK, Tse H, Teng JL, Curreem SO, Tsang AK, Fan RY, Wong GK, Huang Y, Loman NJ, Snyder LA, Cai JJ, Huang JD, Mak W, Pallen MJ, Lok S,Yuen KY†. The complete genome and proteome of Laribacter hongkongensis reveal potential mechanisms for adaptations to different temperatures and habitats.PLoS Genet. 2009 Mar;5(3):e1000416.

Yuen KY*, Woo PC, Teng JL, Leung KW, Wong MK, Lau SK. Laribacter hongkongensis gen. nov., sp. nov., a novel gram-negative bacterium isolated from a cirrhotic patient with bacteremia and empyema.J Clin Microbiol. 2001 Dec;39(12):4227-32.

Woo PC, Lau SK, Teng JL, Que TL, Yung RW, Luk WK, Lai RW, Hui WT, Wong SS, Yau HH,Yuen KY*. Association of Laribacter hongkongensis in community-acquired gastroenteritis with travel and eating fish: a multicentre case-control study.Lancet. 2004 Jun 12;363(9425):1941-7.

FUNGUS

Yuen KY*, Wong SS, Tsang DN, Chau PY. Serodiagnosis of Penicillium marneffei infection.Lancet. 1994 Aug 13;344(8920):444-5.

Cao L, Chan CM, Lee C, Wong SS,Yuen KY*. MP1 encodes an abundant and highly antigenic cell wall mannoprotein in the pathogenic fungus Penicillium marneffei.Infect Immun. 1998 Mar;66(3):966-73.

2018年1月，袁国勇凭借《以防控人感染H7N9禽流感为代表的新发传染病防治体系重大创新和技术突破》项目，获得2017年度国家科学技术进步特等奖。

2009年11月5日，袁国勇在“2009当代杰出华人科学家公开讲座”上作了题为“从禽流感到猪流感”的讲座。

2012年9月3日，袁国勇在南方医科大学作题为“从SARS到MERS（Middle East Respiratory syndrome Coronavirus）病毒演变过程”的学术报告。

2018年1月16日，袁国勇在海南医学院作题为“一带一路下海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室面临的机遇与挑战”的学术讲座。

2019年3月26日，袁国勇在澳门科技大学主讲了题为“临床医生该如何对抗新兴传染病”的讲座。

袁国勇教授是世界知名的微生物学家及内外科专家，对新发现传染病研究及防控工作有宏大贡献。袁教授多年来致力推动香港在公共卫生防护和医学方面的发展，贡献非凡。（香港特别行政区政府评）

袁国勇教授最广为人知的是于2003年香港爆发非典型肺炎（SARS）疫情期间，率领研究小组追查非典发现从果子狸身上验出引致的冠状病毒，他在整个对抗SARS过程中起到了至关重要的作用，病毒的鉴定是疫情最后得到有效控制的关键，因而被誉为“抗SARS英雄”。多年来，凭借丰富经验，袁国勇教授曾多次帮助政府控制疫情在社区、医院或动物中的爆发。（香港文汇报评）

袁国勇和裴伟士发现了冠状病毒（SARS-COV-1）为导致2003年全球重症急性呼吸综合征（SARS）病原，以及由动物到人的传染链，为人类应对MERS和COVID-19冠状病毒引起的传染病产生了重大影响。（未来科学大奖评）

袁国勇院士以其卓越的声誉、非凡的学术造诣和对推动传染病学的坚定奉献，以及在关键时刻对香港特区和中国大陆的重要影响，赢得了广泛认可及敬重。（上海市重大传染病与生物安全研究院评）