在该校峨眉校区举行的2016级本科生开学典礼上，西南交通大学竺可桢书院正式揭牌成立。在峨眉校区就读的960名一本新生成为了竺可桢书院第一批学生。

竺可桢书院未来发展将秉持“一二三四五”五个育人理念。“一”就是一切为了学生，为了一切学生，为了学生的一切。“二”就是两手都要抓，两手也都要硬，即精神成人和专业成才。只有具备了这两点，一个人才可以被称作是人才。“三”则是要将学生培养成为学术大师、管理精英、行业翘楚这三类人才，拓宽学生未来的发展渠道。“四”指的是四位一体，注重学生的价值塑造、人格养成、能力培养、知识探究这四方面。“五”就是该校的“五有”交大人，即有社会担当和健全人格，有职业操守和专业才能，有人文情怀和科学素养，有历史眼光和全球视野，有创新精神和批判思维。

提到“竺可桢书院”这一名称的意义时，徐飞校长表示，该校未来目标是建设交通特色鲜明的综合性研究型一流大学。提起该校的知名校友为人熟知的詹天佑等都是和轨道交通相关的，而竺可桢校友不仅是气象学界的“一代宗师”，更在教育方面颇有建树。书院应运而生，这将有利于专业教育和通识教育有机结合，有助于实现“五有”交大人的培养目标，也更有利于该校致力建设综合性研究型一流大学。