中心核心设备是从荷兰高压工程公司（HVEE）引进的三百万伏特（3.0 MV）串列加速器质谱仪。

加速器质谱仪(AMS)结合了高能粒子加速技术和高分辨率质谱技术，具有极高灵敏度和极少样品需求量，已成为高精度、高分辨率和微量长寿命放射性同位素研究中最前沿的大型仪器装备，其特点是耗时短、效率高，单个样品测量半个小时分析精度即可达2%或更好；样品需求量小，甚至可以少于1mg；分析灵敏度最高可达10，高于常规方法5～7个量级以上。AMS已在地球科学、宇宙化学、环境科学、考古学、海洋科学、生命科学等领域得到了极为广泛的应用，如全球变化研究中最基本的年代标尺的建立、古地磁场变化及气候突变事件的定年和示踪、宇宙事件研究、核污染源的环境示踪与监测、14C年代学、全球水循环以及新药研制中的微计量示踪等。