上卷九章：《止念》、《采药》、《识鼎炉》、《入药起火》、《坎离交媾》、《乾坤交媾》、《攒簇火候》、《阳神脱胎》、《忘神合虚》，其完整的记录了丹功内炼的过程。谓修炼初以止念静心入手，但“止念”并非“同土石草木，块然无情，只有无念之念，谓之正念。正念现前，回光返照，使神御炁，使炁归神，神凝气结，乃成汞铅。”“心动则神不入炁，身动则炁不入神”。采药就是采自身精气神三品上药。法谓“收拾身心，敛藏神炁。心不动则神炁完，乃安炉立鼎，烹炼神丹”。烹炼之法须明玄牝一窍，“真人潜深渊，浮游守规中”，就是守此一窍。知此便可以炁为药入于炉中，以神为火，起火烹炼。烹炼丹药，在丹功谓之坎离交媾，亦称小周天。立基百日之内，见水火升降于中宫，阴阳混合于丹鼎。炁结神凝为验。乾坤交媾谓大周天，在坎离交媾之后见之。至此境界则夹脊如车轮，四肢如山石．两肾如汤煎，膀胱如火热。神气混融，水火升降，运行一周。“当此之时，身心混然，与虚空等，不知身之为我，我之为身，亦不知神之为炁，炁之为神。似此造化非存想，非作为，自然而然，亦不知其所以然。”内炼火候，丹经皆以卦象为喻，依之进阳火，退阴符。等功行圆满，则玄珠成象，归根复命，抱本还虚。“忘神还虚”为最后一层功夫。达到身外有身，形神俱妙的境地。