参编：

1、《辛亥革命与20世纪中国——1989－1999年辛亥革命论文选》，湖北人民出版社2001年。

2、《辛亥革命史资料新编》，湖北人民出版社2006年。

1、《苏联与武汉会战》，《华中师范大学学报》1999年第2期。人大报刊复印资料《中国现代史》1999年第8期转载。

2、《试论武汉会战期间的中苏关系――以张鼓峰事件为中心》，《纪念武汉会战暨中山舰遇难六十周年国际学术研讨会论文集》，湖北人民出版社1999年

3、《梁启超民族国家思想研究》，《华中师范大学学报》2000年第2期。人大报刊复印资料《中国近代史》2000年第7期全文转载。

4、《双重政治文化认同的困境——解读梁启超民族国家思想》，《安徽史学》2001年第1期。

5、《孙中山国家统一思想的理论基石》，王功安、林家有主编：《孙中山与祖国的和平统一——纪念辛亥革命九十周年学术讨论会论文集》，中山大学出版社2001年。

6、《论20世纪初年新式知识分子民族国家观念的提出》，《华中师范大学学报》2001年第5期。

7、《1903年留日学生刊物的传播网络》，《中州学刊》2001年第6期。

8、《20世纪初新式知识分子的民族国家理论建构与认同》，胡春惠、周惠民主编：《两岸三地历史学研究生论文发表会论文集》，台北国立政治大学历史系2001年。

9、《1903年前后新式知识分子的主权意识与民族国家认同》，《天津社会科学》2002年第4期。此文入选“纪念辛亥革命九十周年国际学术研讨会”，收入中国史学会编：《辛亥革命与20世纪的中国》，中央文献出版社2002年。

10、《晚清国人的民族国家身份认同及其困境》，《华人华侨历史研究》2003年第2期。

11、《清季改籍问题的社会史考察》，《浙江学刊》2003年第6期。

12、《清季国籍问题与民族国家身份认同》，《天津社会科学》2003年第5期。人大复印资料《中国近代史》2004年第1期全文转载。

13、《20世纪初“非省界”与“筹边建省”思潮合论》，《史学月刊》2004年第10期。

14、《罗家伦与抗战前的中央大学》，台北《近代中国》第163期，2005年12月。

15、《罗家伦与中央大学的战前精神动员》，涂文学、邓正兵主编：《抗战时期的中国文化》，人民出版社2006年。

16、《20世纪初新史学与民族国家观念的兴起》，《社会科学研究》2006年第6期。人大报刊复印资料《历史学》2007年第2期全文转载；《新华文摘》2007年第11期“论点摘录”。

17、《从“国学研究会”到“国学院”——东南大学与20世纪早期南北学术的地缘与派分》，《江苏社会科学》2006年第2期。

18、《论东南大学的国立化进程及其困境》，《高等教育研究》2006年第2期。

19、《南京国民政府初期中央大学区试验及其困境》，《近代史研究》2007年第2期。此文被人大复印资料《中国现代史》2007年第8期全文转载；被《历史教学》（高教版）论点转摘。

20、《种族与政治：清季中国人对“黄祸论”的人种学回应》，《近代史学刊》2007年第4辑，华中师范大学出版社2007年。

21、《社会调查真开始于民国吗》（合著），《甘肃社会科学》2008年2期

22、《北伐前后北京的国立大学合并风潮》，《中山大学学报》2010年第1期。《中国社会科学文摘》2010年第6期重点转载。《高等学校文科学术文摘》2010年第2期重点转载。人大复印报刊资料《高等教育》2010年第5期全文转载。

23、《张其昀与南高学派》，《近代史学刊》2010年第7辑，华中师范大学出版社2010年。

24、《辛亥革命与近代民族国家认同》，《史学月刊》2011年第4期。

25、《〈时代公论〉与抗战前南北政治文化》，《中山大学学报》2011年第3期。人大报刊复印资料《中国现代史》2011年第10期全文转载。

26、《南高学派与现代中国的文化民族主义——以孔子观为中心的探讨》，《华中师范大学学报》2011年第5期。《新华文摘》2011年第22期论点摘录。

27、《功利与自由——郭秉文高等教育思想与实践论析》，《郭秉文与东南大学》，东南大学出版社2011年。

28、 《南京国民政府两次迁都之争》，《暨南学报（哲学社会科学版）》2012年6期

书评、综述及其他

1、《台北“近代中国的改良与革命——纪念辛亥革命九十周年学术座谈会”综述》，《辛亥革命研究动态》，2002第1期。

2、《台北“辛亥革命九十周年国际学术讨论会”综述》，《辛亥革命研究动态》2002年第1期。

3、《“中华民国史（1912－1949）国际学术讨论会”综述》，《辛亥革命研究动态》2002年第3、4合期。

4、《用“双重外交论”来解开近代中日外交关系之迷——评俞辛焞教授新作〈辛亥革命时期中日外交史〉》，《华中师范大学学报》2003年第6期。人大复印资料《中国外交》2004年第2期全文转载。

5、《辛亥革命史》，仓修良主编：《中国史学名著评介》第五卷，山东教育出版社2006年。

6、《对近二十年民国学术史研究的回顾》（与罗福惠教授合著），中国社会科学院近代史研究所编：《中华民国史研究三十年》（下卷），社会科学文献出版社2008年。

7、《倾心半世纪 领潮海内外——章开沅先生与辛亥革命史研究》，《华中人文论丛》2010年第2期。