焦氏作补疏者有《周易》《尚书》《毛诗》《左传》《礼记》等，合为《六经补疏》，是书为其中之一种，并经阮元刻入《皇清经解》。是书名“补疏”，者，乃邢□昆《论语注疏》之未备也。焦氏以为，《论语》一书，阐发伏羲、文王、周公之旨，其文简奥，惟《孟子》阐发最为详畅，后代注本，邢注较为博贯，然邢注间有疏略未备，故“参伍错综，引申触类”，名曰“补”，实大都阐发己意者为多，且尽致发挥。其驳正补注邢疏者，虽有可采称允之处，而精到处不多，在诸补疏中非为上乘之作，然其发明己意之处，能阐论其人伦道德、政治思想，给人以启发思考。

有《焦氏丛书》本，《皇清经解》本。