继位时教廷入不敷出，赖他改革赋税制度、厉行节约、争取各天主教国家经济支援得以避免崩溃。英诺森资助波兰国王扬·索别斯基和神圣罗马帝国皇帝利奥波德一世与奥斯曼帝国作战，1683年结束维也纳的被围困状态。1673年法兰西国王路易十四发布谕令，宣布国王有权任命主教以填补空缺，英诺森就此与路易十四发生争执。路易遂召集法兰西宗教会议，颁布高卢条款，主张限制教皇权力。英诺森宣布，凡与此次会议有关的教士一律不得提级，于是僵局更加恶化。英诺森鉴于必须容忍新教会才能维持和平，因而反对路易迫害胡格诺派。法兰西驻教廷大使馆滥用政治庇护权，以致罪犯纷纷窝藏在大使馆周围，1685年英诺森对该大使馆采取行动，使决裂危险更加严重。在教义问题上，英诺森多少同情詹森派。虽然与西班牙神秘主义者寂静派创始人莫利诺斯友善，却听任教廷警察逮捕莫利诺斯，以道德败坏和异端罪审讯。莫利诺斯被判无期徒刑，他的学说于1687年受到英诺森的谴责。