传统的财政联邦主义理论是关于公共部门职能合理分配和不同层次政府间财源合理分配的理论。20世纪80年代以来，财政联邦主义基础理论的各个方面都出现了一些新观点，其分析方法也出现向政治经济学分析和公共部门制度分析发展的趋势，并出现了实验联邦主义和福利改革、财政联邦主义在转轨经济国家和发展中国家的发展以及财政联邦主义与区域经济一体化等新的理论问题。

我国1994年开始实行的分税制财政体制作为一种新的制度安排,具有明显的过渡性,在运行中取得积极成效的同时,仍然存在一些问题。针对这些问题,可以从合理界定各级政府之间的事权与财权、建立规范的财政转移支付制度以及完善省以下的分税制等方面加以改革和完善。