植物体中有几种PQ，它们的区别是异戊二烯单位数目不同。叶绿体中最多的是PQ9。在光合链中，既可传递电子，又可传递质子，其氧化还原反应：氧化还原电位约为0.1伏。氧化型的PQ从类囊体膜的靠外一侧接受电子，并与膜外质子结合，尔后向内扩散，在膜内侧被细胞色素f氧化，交出电子，同时把质子释放到膜内腔。即伴随PQ氧化和还原作用，使质子从膜外横渡膜进入膜内腔。这种质子的移动与光合磷酸化有关。