贵州大学昆虫研究所即在此基础上，于1999年经学校批准，成立的隶属于农学院的教学科研单位。该研究所现是“贵州山地农业病虫害重点实验室”、“植物保护”一级学科博士点、“动物学”博士点和“动物学（昆虫学）”省级重点学科的主要依托单位，国家一级刊物《昆虫学报》的协办单位。

研究所现有研究队伍15人，其中教授7人，副教授8名。具有博士学位的11人，在职攻读博士学位1人。有博士生导师5人，硕士生导师10人。国家“百千万人才工程”一、二层次人选1人，贵州省省管专家2人，贵州省跨世纪科技人才1人，贵州省优秀青年科技人才2人。另有5名实验室工作人员。现已形成昆虫系统学、蜱螨学、昆虫生态学、农业有害生物综合治理、资源昆虫学、城市昆虫学、入侵生物学和分子生物学等多个稳定的研究方向。