某日，ZAP SPACY收到了求救信号，雷等人迅速驾驶盘龙号前往，但却被吸进扭曲空间。

在扭曲空间的一颗小行星切尼上，雷他们遇见了其他次元的自己，并且出现了一头机械哥莫拉，而且还见到了与萨罗梅星人派来的机械奥特兄弟和机械哥莫拉展开生死战斗的赛罗奥特曼的雄姿。

原来在这个星球上，萨洛梅星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一起。雷召唤哥莫拉迎战机械哥莫拉不敌，正当危急之际，赛罗奥特曼出现营救。而为了计划的继续进行，萨洛梅星人启动了黑暗独眼巨人赛罗。