伊丽莎白在抵达西班牙后不久便成为了“马德里的偶像”。她给公公费利佩五世国王和丈夫费利佩王子留下了良好的印象。不过，她很快就和她的婆婆——盛气凌人的埃丽莎贝塔王后相互反感。由于法国还未支付伊丽莎白的嫁妆，而且也没有在英西战争中协助西班牙，因此，王后是恼火的；而且，据说大约六个月后，王后意识到她将无法像对待丈夫和儿子那样控制或左右伊丽莎白，她的儿媳可能会取代她成为对费利佩最有影响力的人。因此，伊丽莎白几乎不待在王后身边，她与玩偶为伴，并且以写信的方式向父亲述说自己的愁苦。伊丽莎白很快就控制住了费利佩；虽然费利佩比伊丽莎白大8岁，但据说，他和他父亲一样，生性胆怯、被动且唯命是从。据说，伊丽莎白对费利佩产生了感情，但总的来说，她还是将费利佩视作“一个比她本人小很多的男孩，即使他比她大八岁”。吕内后来注意到：“虽然这位二十八岁的王子就像一个十四岁的孩子，但他还是深情地爱着王妃。”

伊丽莎白被描述为：“思维敏捷、雄心勃勃且有进取心，她精力充沛，热衷于为家人筹谋，向所有人灌输亲法思想，并立志于将儿子培养成一位配得上他伟大的法国祖先的王子。”在西班牙宫廷内，作为一个几乎不可能成为王后的王妃，伊丽莎白对自己所处的从属地位感到不满。她通过写信与法国宫廷保持联系，尤其是与她的孪生妹妹亨利埃特，她把西班牙宫廷内发生的所有事情都告诉了弟弟法国王太子路易·斐迪南，并于1740年在法国宫廷内建立了一个联络网，以协助她实现为自己和丈夫获得独立政权的野心——“两个都值得拥有”。据说，伊丽莎白的孪生妹妹亨利埃特、另一个妹妹阿代拉伊德以及嫂子玛丽亚·特蕾莎·拉斐拉都热衷于帮助伊丽莎白实现政治理想，而这些人原本都对政事漠不关心。为了实现这一目标，有权有势的诺阿耶和莫尔帕伯爵让-弗雷德里克·菲利波还与王后结盟，据说，法国驻马德里大使因愿意为伊丽莎白提供帮助而受到嘲笑。

1741年，费利佩被叫去参加奥地利王位继承战争，希望他通过这场战争能获得意大利北部的一块公爵领。据说，为了不让伊丽莎白取代自己在费利佩心中的地位，在埃丽莎贝塔王后的坚持下，开战时费利佩几乎都留在营地内；王后在信中反复问儿子是否爱他的妻子：“我想知道你爱不爱 . : [埃丽莎贝塔·法尔内塞在给儿子写信时用来表示儿媳的符号]告诉我实话！”不过，虽然伊丽莎白和埃丽莎贝塔·法尔内塞相互讨厌，但事实上她们有共同的野心和奋斗目标，即为费利佩王子争取独立统治权。在战争期间，埃丽莎贝塔·法尔内塞确致力于确保儿子费利佩在意大利的统治权，而伊丽莎白也动用她的全部人脉关系做着同样的事。