不过，到目前为止，这种技术仍然处于起步阶段，并且没有一种含有从其它动植物上种植基因的食物，实现了大规模的经济培植。同时许多人坚持认为，这种技术培育出来的食物是“不自然的”。

转基因大豆中的粗脂肪、粗蛋白、脂肪酸、黄酮和酚酸的含量都明显高于非转基因大豆。并且．这些物质均具有提高植物对物理环境的适应性．增强植物抵御天敌侵袭及抵抗病害的能力。

世界上第一种基因移植作物是一种含有抗生素药类抗体的烟草，1983年得以培植出来。又过了十年，第一种市场化的基因食物才在美国出现，它就是可以延迟成熟的番茄作物。一直到1996年，由这种番茄食品制造的番茄饼，才得以允许在超市出售。

为什么一些人认为转基因技术或许对人类健康有害呢？批评者认为，当前我们对基因的活动方式了解还不够透彻。我们没有十足的把握控制基因调整后的结果。批评者担心突然的改变会导致有毒物体的产生，或激发过敏现象。

另外还有人批评科学家所使用的DNA会取自一些携带病毒和细菌的动植物，这可能引发许多不知名的疾病。我们应该相信我们所吃的食物吗？

为了确保消费者的安全和维持信心，所有食品都必须经过一系列的检测管理程序。检测程序的目的是在食品上市前就发现问题。如果消费者不幸因为所吃的食品而得病，这往往是因为食品生产线存在问题。

美国的转基因大豆出油率高、价格比中国东北大豆更便宜，由于商人逐利的本性，美国公司和中国中粮集团都大量进口美国大豆，美国大豆油已占垄断地位，中国食用油行业面临安全隐患。不论从国家产业安全，还是保证中国人种不因大量使用美国大豆油而变异，中国政府都有义务扶持国内大豆生产、限制美国大豆进口。

2005年世界上种植转基因大豆的国家已超过了7个，转基因大豆种植面积所占比例情况如下：美国81%，阿根廷100%，巴西20%，乌拉圭100%，巴拉圭、南非、罗马尼亚、加拿大等国转基因大豆也在发展。当前国际市场上转基因大豆主要有两种，即抗除草剂转基因大豆和抗虫转基因大豆。当前应用面积较大的是抗草甘膦除草剂的转基因大豆。2006年，转基因大豆依然是最主要的转基因作物，占全球转基因作物总种植面积的57%（

转基因作物释放到环境中，可能威胁到传统的野生物种，影响生物多样性。一方面，经过转基因技术改造的生物体，由于它们在性状与品质上优越于其他自然生物体，按照达尔文的“物竞天择，适者生存”的生物进化论与竞争机制，会消除生物群落中的野生种，并通过食物链间接影响生物群落的结构，威胁生物多样性。另一方面，转基因作物的基因漂流到其他物种上，与其他物种杂交，产生比野生植物具有更强的特性的植物，也会影响生物群落结构与生物多样性。

转基因大豆对生物资源和生态系统可能带来的风险主要包括：⑴可能影响生物的多样性。转基因大豆是一种优势大豆品种，会限制非转基因大豆品种的发展，从而影响大豆品种的多样性。一方面，转基因大豆具有较高的经济效益，这促使大豆种植者选择种植转基因大豆而放弃非转基因大豆；另一方面，转基因大豆会通过“基因漂移”而破坏非转基因大豆的原始基因。⑵可能引起耐除草剂杂草的蔓延。研究表明，转基因大豆使用除草剂量较种植非转基因大豆多11.4%，这无疑会加速抗性杂草的发展，会使某些物种抗性剧增。⑶转基因大豆大面积种植，除草剂的用量将增多，相应的土壤和水体中除草剂含量也将增多，最终会影响土壤和水生生态系统。研究发现，当草甘膦溶入土壤进入到地下水，若水温升高，pH值超过7.5时，会对水生生态系统产生毒害作用。

对于转基因大豆，人们有两大类忧虑，一类是出于健康角度，一类是出于生态角度，生态角度又包括产生超级杂草和影响中国的本土大豆品种两方面。而绿色和平当前的战役则是让南顺油脂有限公司提供非转基因大豆油。

我们可以根据一些基本知识和常识来分析这些忧虑有多大程度上是现实的。

从健康角度来说，就是转基因的大豆油是否含有对人类有害的成分。对于食用油，我们知道其主要成分是甘油三脂，而转基因大豆所转移的基因的作用就是让植物产生更多EPSPS酶，和植物油脂的成分没有关系，所以大豆油的主题成分和是否是转基因植物生产出来的无关，关键是是否有些微量成为混杂在其中从而影响人的安全。这些有害的成分被猜想可能来自以下几个方面。第一是所转的基因片断进入人体，影响人类的基因。第二是过多的EPSPS合成酶进入人体，从而以影响人类的健康。第三是所转基因可能会有人类所不知的功能，是植物能合成一些对人类健康有害的物质，并随大豆油进入人体造成影响。第四是作物可能会被施以过多的草甘膦除草剂，这些除草剂可能随大豆油进入人体，影响人体的健康。

对于影响人类的基因，这点可以说是完全不存在的。道理不难理解，如果所转的基因片断能影响人类的基因，那么食物的常规基因也就同样能影响，而对于人类来说，二者都是来自人体之外的外来基因，没有区别的。从人的生理角度来说，人只能吸收小分子，基因是位于DNA上的，DNA是大分子，在消化道中会被分解成小分子的核苷酸。而DNA上所记载的遗传信息的不同只是核苷酸的排列顺序不同，如果被消化成了独立的核苷酸，也就不存在排列顺序了，不存在任何遗传信息，也就不再是基因了。EPSPS酶是一种蛋白质，蛋白质也是大分子，经过消化会变成氨基酸，酶也就不存在了，但是应考虑到人体是否能够完全消化，若有部分残留肠道内是否会有其他影响有待验证。对于这个转过的基因是不是有别的人们不知道的功能，这个忧虑也许是有可能存在的，但是如果有也微乎其微。所转的只是功能比较单一的基因片断，人们对其功能比较了解，相反用传统方法培养的新品种反而人类更难预料其效果。同时，现有的检测手段尚未发现转基因大豆油中含有对人体有害的成分，转基因大豆油也已经被使用了相当一段时间，也尚未发现因此导致人健康问题的实例。对于残留除草剂的问题，首先并非是只有转基因作物才用除草剂，而对于食品残留除草剂等问题，是按照有关食品安全法规进行检测的，这点可以不用忧虑。

从生态角度来说，首先，没必要产生对抗草甘膦大豆成为超级杂草的忧虑，因为大豆只能抗草甘膦这一种除草剂，并不能抗其它的除草剂，也并非能抗病虫害，又没有其它竞争优势，转基因大豆成为杂草的可能和传统大豆没有区别。大豆在中国种植了几千年，并没有形成严重的杂草。同时能抗除草剂的作物又远不限于转基因大豆。

对于影响本土大豆资源这一点，也不必忧虑，这里有两个很关键的环节。第一，大豆是自花授粉，第二，如今只是从国外进口转基因大豆，并没有在国内种植。而对本土大豆资源造成威胁，只有通过一种途径，就是转基因大豆在本土大豆附近开花，和本土大豆杂交，使得本土大豆产生的后代具有转基因成分。我们稍加分析就知道这个的发生几率非常小。首先，我们并没有种植转基因大豆，如果大豆开花，那也就是从进入海关到在加工厂加工成豆油之间的这段时间有散落到地里的大豆，或者有人把大豆偷出去种。这个几率是很小的。而中国本土大豆的集中地在东北，而绿色和平主要反对的那个豆油加工厂位于深圳。如果在深圳流失了几个豆子开花结果，一代一代传下去，一直传到东北，这可不是那么容易实现的。当然，并不是本土大豆品种都在东北，也不是豆油加工厂都在深圳，但是如果考虑距离因素，这个折扣还是要打的。即便是在本土大豆产区周围已经有了很多转基因大豆在开花，仍然不一定造成很大的威胁，这就是因为大豆是自花授粉，虽然偶然会发生异花授粉而引起杂交，但是这个比率是很小的。而即使发生了杂交，杂交的后代产生优势并足以让本土某个或者很多品种消失则又有个发生几率的问题，但流通到市场，农户大面积种植后，后果是难以计算的。

食用大豆油经过复杂的加工环节，DNA降解和破坏极其严重，给转基因检测带来了极大的困难，检测中容易出现假阴性。因此，提取开始前，利用DNA可溶于水溶液的特性，在食用油脂中加入一定体积的TE溶液进行洗涤，这一步骤对于成功提取DNA至关重要。通过改进DNA提取方法、针对内源基因设计质控引物、控制扩增片段长度、使用不同检测技术等方法，排除假阴性并提高了检测灵敏度，使大豆油转基因成分的核酸检测技术日趋成熟。实时荧光定量PCR技术，不但具有高灵敏度和快捷的优点，而且使转基因检测既能够进行定性，还能进行定量，成为转基因检测的趋势。当前，国际上仍然没有建立统一的植物油转基因检测方法，这是一个亟待解决的问题；而对食用大豆油转基因成分的定量检测则是未来检测的另一个方向，也是对检验人员的一个极大挑战。

转基因大豆进入中国以后，大部流进入了外资背景的食用油加工企业，其产品很快占领了大部分市场，从而影响了中国大豆加工资源环境，不利于本土食用油加工企业的发展。中国本土的一些食用油加工企业，由于使用的是非转基因大豆等原料，与转基因大豆油相比，价格较高，不具有竞争力，在转基因大豆油的价格支配下，中国油脂企业效益急剧下滑，经营陷入困境。回望中国大豆市场被进口转基因大豆主宰的过程，可以清楚地看到全球四大国际粮商（ADM、邦吉、嘉吉和路易达孚）极富战略眼光，为吞下中国大豆产业意在长远。首先，改变中国人传统烹调油的饮食习惯；其次，国际粮商作为引进的外资，享受优惠政策，在中国相继投资建起以进口大豆为原料的压榨加工企业。与此同时，国内资本也涉足以进口大豆为原料的榨油领域，越来越多的国内资本进入大豆压榨领域时，压榨企业于是便遍地开花。于是中国的经济学家、产业界沉醉于世界大豆压榨重心东移，我们劳动力具有比较优势，中国成为世界加工厂的进程加速，殊不知我们早已一步步落入四大国际粮商的口袋中。

由于加工能力扩张，大豆原料紧张成了加工压榨企业时时头痛的问题。2004年，一些内资压榨企业决定成立采购团到美国购买大豆，以增加讨价还价的能力。而就在采购团赴美前夕，美国农业部发布消息称，该年度大豆欠收。当天美国芝加哥期货交易所大豆价格猛涨，从先前每吨220美元暴涨到391美元，创15年来的新高。当中国采购团签下巨额采购合同离美后不久，美国农业部出面澄清，新的数据显示世界大豆产量将大增。芝加哥期货交易所大豆价格迅速掉头向下，暴跌至266美元。中国商人损失惨重，一些企业破产。

不过，也有评论认为，采购团在下单之前过分宣扬（而不是保守秘密）是推高市场预期的原因，而并非一个阴谋。

这时，四大国际粮商及时“雪中送炭”，让濒临破产的中国压榨企业继续运营下去，条件是转让股权。由此四大国际粮商借机收购、控股了一大批中国压榨企业，完成对中国大豆压榨加工产业的布局。数据显示，全国97家大型油脂加工企业中，外资控制了64家，占66%，外资还占有中国进口大豆加工能力的80%。

在完全控制了中国大豆产业链的原料、加工、市场的各个环节后，国际大豆期货市场再次兴风作浪。受国际市场影响，2007年国内大豆期货价格从年初2600元到年底时涨至4100元，2008年继续飙升，7月达到最高5240元。短短18个月，价格翻了一番。夏友富在2006年9月25日的转基因国际论坛上公布了他的研究发现，“这并不是由需求产生的，而是由市场垄断产生的。中国因为是世界上最大的大豆进口国，价格暴涨让中国多付78亿美元。”他说，“我们愿意拿出数千亿美元去国外买转基因大豆，并多支付78亿美元，却不愿意把钱补贴给农民。可能只要10亿人民币用于大豆种子的研究开发，就能让中国农民用上更好的种子。”

更可怕的是，转基因大豆试图在中国进一步扩展地盘，中国的腐败分子及不法商人和美国转基因大豆供应商联合设套，想让转基因大豆混进中国粮库。去年年末，黑龙江省粮食部门发现，一些经销商利用国家以优惠价格收购国产大豆的政策，将疑似进口转基因大豆冒充国产大豆，卖给国家粮库赚取价差。黑龙江大豆协会调查证实，11月，山东新昌食品公司拒收黑龙江佳木斯贸易商销售的大豆，原因是其中混入了疑似转基因大豆，此前，这家佳木斯贸易商销售的一直是黑龙江的国产大豆。可以毫不客气的说，一旦中国的粮库里充斥着转基因大豆，中国的大豆产业就会全部被美国人所掌握，中国的国家安全也就越来越攥在美国人的手里。

新华社2013年6月13日晚发布消息称，农业部日前批准发放了三个转基因大豆进口安全证书，但并未说明进口的是哪些国家。此前，曾有消息称中国政府已批准进口阿根廷和巴西的转基因农作物。

由于转基因大豆，培育目的是抗虫，抗药，所以分辨方法应该从这一特点出发，一般非转基因的大豆，偶尔能看到虫蛀的痕迹。

另外，非转基因大豆，如果保存不善也容易生虫，而转基因的大豆通常形态整洁，几乎看不到任何虫蛀痕迹。

再有，难以通过发芽方法分辨，是否非转基因，因为世界范围内广泛种植的Roundup Ready转基因大豆。