更新时间：2024-10-30 10:50
小燕子（黄奕饰）虽然已与永琪（古巨基饰）完婚，依旧是笑话常闹，祸事不断的“开心果”，在随皇阿玛(狄龙饰)“南巡”途中，山东正闹饥荒，小燕子一激动，将随身携带的食物全部给了灾民，乾隆也只好忍饥挨饿，山东地方官为了讨好乾隆，用山珍海味款待，小燕子、永琪、尔康、紫薇联想到灾民惨状，忍不住大闹酒席，乾隆也被他们的正义行为所感动。
“南巡”路上，紫薇（马伊琍饰）和尔康（周杰饰）恩恩爱爱，永琪和小燕子快快乐乐，只有晴儿（王艳饰）和箫剑（黄晓明饰）陷入相爱却不能相聚的痛苦之中，小燕子对哥哥的痛苦看在眼里，挂在心中，到了杭州，她与永琪、紫薇、尔康商量好，偷偷安排了一条船，掩护晴儿与箫剑相会，卫兵误以为刺客，欲登船擒拿，小燕子等人仓卒出手，打斗惊动了皇上和皇太后，也暴露了晴儿与箫剑的恋情而受到太后的斥责。
此时乾隆无心关注儿女之事，他的心已被江南歌姬夏盈盈（蒋勤勤饰）所迷，并宣称要封夏盈盈作妃子，此事惊动了太后和皇后，皇后（姜黎黎饰）为保全皇帝的声誉，呈血书恳切力谏，乾隆大怒，将皇后遣回京城。皇后几年来洗心革面修复的夫妻之情倾刻化为乌有，最终只能面对“削发为尼”的结局。
其实在南巡路上，大家还认识了海宁陈邦直的小女儿知画（秦岚饰），太后（赵敏芬饰）看她温柔娴雅，又多才多艺，决定把她带回京城，而知画和她的父母竟然毫不犹豫地答应了。晴儿看到知画来到太后身边，决定和箫剑远走高飞，尔康又假传圣旨，用金牌令箭放走了他们，乾隆大发雷霆，无奈，箫剑和晴儿这对苦命鸳鸯又赶了回来。
回到京城，太后查清了小燕子兄妹的身世，为防不测，将箫剑囚禁起来，在营救过程中，小燕子知道了杀父仇人竟然是最亲近的皇阿玛，从此，她对永琪的爱渐渐冷却，对乾隆的恨渐渐加深。为了保守秘密，太后提条件让永琪娶知画，婚礼当天就会放了箫剑，小燕子为了救哥哥，只好忍痛割爱，无奈之下，永琪和知画完成了婚礼。他们成亲以后，小燕子与知画的冲突不断，知画为了得到永琪，也与小燕子展开一场战争。
边疆的战火燃起，死里逃生的永琪与尔康率大军挥师南下，反击缅甸军队的进犯，清军虽然大胜而归，也带回了战死沙场的尔康的尸体，紫薇悲痛欲绝，为了与在天国的爱人相会，紫薇跳下了幽幽谷，谷底突然飞出成千上万的蝴蝶，组成彩色的云团托起紫薇，迷幻中有人告诉她：尔康没有死。而就在大家沉浸在悲痛之时，知画产下一子，取名绵亿，这使小燕子的醋意更加浓密。
尔康真的没有死，缅甸王猛白的八公主（刘涛饰）在刀光剑影中爱上了尔康，乘尔康受伤将其抢回行宫用“调包”的假象蒙骗了永琪，也蒙骗了紫薇，因受伤而意识模糊的尔康错把公主当成紫薇，深陷敌国，被迫成亲还在异国染上了药瘾。
箫剑知道此事后来到北京，告诉紫薇真相，虽然没有把握，但是紫薇深信这是真的。大家面见乾隆，乾隆逼问箫剑的来历，知画把真相揭开，箫剑和小燕子因为仇恨而失去理智，箫剑上去掐住乾隆的脖子，小燕子拔下永琪的剑刺向乾隆，永琪奋力抢救，中剑的永琪却痛定思痛手腕被重重地划了一刀，并要挟箫剑放手。箫剑又要除掉永琪，被小燕子制止。小燕子心中的仇恨之火终于被永琪、紫薇的真爱之泉所浇灭。
紫薇决定南下寻夫，永琪为了小燕子也决定放弃王位，离开皇宫，乾隆不但成全了他们，也成全了箫剑和晴儿这对苦苦的恋人。离开时，知画抱着绵亿追着永琪，小燕子也终于知道知画对永琪的感情，但是马车头也不回地走了。
猛白要挟八公主和尔康结婚，但是缅甸八公主决定放掉他，让他跟紫薇继续“生死之交”，一行五人历经千辛万苦，终于在异国他乡与尔康相聚，各诉衷肠。后来，因尔康染上药瘾需戒掉，戒药时尔康曾打紫薇。后来，终于成功了。为了庆祝尔康戒药成功也同时让晴儿和箫剑如愿，他（她）们办了一个各个民族聚集地婚礼，婚礼中还爆出惊天大料小燕子怀孕了。尔康和紫薇要回北京，大家恋恋不舍。星移斗转，隐居在大理的永琪和小燕子早已儿女满堂，一天两位不速之客突然光临，永琪小燕子一见，大吃一惊，原来是日思夜想的皇阿玛和尔康。箫剑和晴儿带着儿女赶来相聚，三代人欢聚一堂，阵阵笑声久久回荡在天上人间。
（剧情简介参考资料来源：）
（分集剧情参考资料来源：）
（演职员表参考资料来源：）
（角色介绍参考资料来源：）
（音乐原声参考资料来源：）
《还珠格格第三部》从筹拍之日起，琼瑶一直希望能够以原班人马拍摄。但由于当时国内的经纪约定不健全，琼瑶公司的工作人员没有和演员沟通好，演员对剧本不满意等，原班人马除了周杰、王艳、赵敏芬、温海波、刘芳外，林心如、苏有朋等都无档期，琼瑶不得不发动剧组重新物色演员。经过在北京近一个月的挑选，琼瑶终于敲定三个主要男演员名单。
该剧采用边拍边剪的方式，同时增加了战争场面以及包括大象、马在内的动物戏。
为了该剧最佳的拍摄效果，专程购置的高档轨道车，从台湾碾转至香港，再到天津海关运送至北京。83箱物资分别是拍摄用的摄像机、和编辑机，以便同期剪辑，还有专用的磁带，电池。还有两百多套从《还珠格格》第一、二部库存中精心挑选的合时宜的服装和刀具。除此之外，还有大量的群众演员服装和化妆用品。
2002年4月，该剧开机拍摄。9月3日，该剧在北京杀青。2003年2月，该剧在台湾和香港进行后期制作。
2003年7月5日，剧组成员在香港举行“还珠格格，蓄势再发”记者会。2003年7月7日，湖南卫视、南京电视台影视频道举办《还珠格格第三部》南京见面会。2004年1月13日，剧组成员参加湖南卫视为其举办的系列宣传推广活动。
2003年7日，《还珠格格第三部》在广州的影视频道播出，平均收视率为2.5%，最高收视率为4.5%，台湾平均收视率为1.98%（AC尼尔森公司统计数据）；但在深圳、西安、南京、武汉等别的城市播出时，其收视情况在2003年收视最高：深圳的平均收视率为7.84%，最高收视率为10.36%；武汉的平均收视率为11.5%，最高收视率为12%；天津的最高收视率为28%；南京电视台影视频道的平均收视为10.8%，最高收视为11.4%（央视央视—索福瑞公司统计数据）。截至2004年1月，湖南省的平均收视率为15.9 %，平均收视份额为33.4%；在长沙地区的平均收视率为11.9%，平均收视份额为28.15%；北京的收视率将近6.0%（央视央视—索福瑞公司统计数据）。
《还珠格格第三部》的整体制作的确非常精良，服装华丽、画面唯美、特技精彩。服装和场面比前两部精致，象阵”与“马阵”对垒的大场面战争戏，十分壮观。把故事发生地放到异国氛围中，民族风情浓厚。（《成都晚报》评）
《还珠格格第三部》除了周杰饰演尔康、王艳饰演晴儿、赵敏芬饰演太后、温海波饰演福伦、刘芳饰演福晋不变外，其他主要角色都更换了演员，演员在表演的时候无法摆脱前任演员的影子，无法表现出演员自己的表演本色，反而画虎不成反类犬，成了整部剧最大的败笔。（《成都晚报》评）
该剧不但被认为是《还珠格格》第一部、第二部的续貂之作，也是整个系列最为“雷人”的一部。除了让人崩溃、完全违背历史的剧情之外，完全更换的演员阵容也是观众抨击的对象。琼瑶阿姨虽然努力想让故事维持在琼瑶剧应有的水准之上，但却让故事在喜剧和悲剧之间摇摆不定，演员程式化过了头的表演更是让“还珠迷”都受不了。另一方面，观众更多的去关心两版“小燕子”、“紫微”的表演，至于已经狗血了的剧情，他们都不想关心。（中国广播网评）