申报进口废物应向海关提交允许废物进口的《进口废物批准证书》（2005年已经停止使用），并标有环境保护部废物进口审批专用章；如果是《自动进口许可管理类可用做原料的废物》目录的进口废物，还要标注自动进口许可的字样，以示两者的区别。海关对《进口废物批准证书》实行“非一批一证”的管理，经营单位或者其代理人每次申报废物进口的批准证书，海关在证书的背面加盖核销章，知道用完该证书。进口废物除需要《进口废物批准证书》外还需要入境货物通关单；进口废物不能办理转关（废纸除外），只能在进口岸办理手续。