连江县政府在县长之下，设有18个一级机关单位包括12个局，5个处，1个室;而二级机关单位市/镇/乡公所方面则4个。连江县县政府并置县政会议，为县政最高决策机构，县政会议是连江县准直辖市县政府酝酿政策的地方，县长在重要决策或向连江县议会提交法案前均先由县长会同县政会议通过每周举行一次，由县长、秘书长、副秘书长、局长、处长、委员会主任委员，与县长指定之人员组成。县长为县政会议之主席，当县长因故不能出席时，由县长指派副县长代理县长担任主席；当副县长也不能出席时，则指派一级机关单位其中一位首长包括秘书长代理县长担任主席，必要时县长得邀请或指定其他有关人员列席。

连江县副县长（一名，特任职）