（以上参考来源）

新学期开始，迪拉诺剑山以优秀的成绩进入了决斗学院的“太阳神・黄”宿舍，一到学院便在小森林的吊桥边进行狩猎决斗，输的人不仅要交出自己的决斗盘还要被收作小弟加入加入“最强的迪拉诺团”，得知了这个传闻的游城十代很兴奋便去和剑山决斗。剑山代理众小弟应战，但在决斗的过程中剑山自己的小弟都跑光了。虽然没了小弟，但是通过和十代的决斗剑山了解到了自己所缺少的东西，在决斗惜败后解散了“迪拉诺团”，并在傍晚收拾行李搬进了十代的宿舍居住，并把十代认作“大哥”。

由于十代等人的影响，越来越多的“太阳神・黄”宿舍成员都搬出了宿舍，这时候在红宿舍外出现了一位头戴不透明纸袋穿着怪异却能做出美味咖喱的“咖喱魔人”，“咖喱魔人”提出条件：想吃咖喱便要和自己决斗，但要是输了的话在红宿舍待的黄宿舍成员必须回黄宿舍，剑山接受了这个决斗，经过苦战剑山取得了决斗的胜利。这时候“咖喱魔人”脱掉了怪异的装束，原来“咖喱魔人”就是“太阳神・黄”的宿舍长桦山老师，桦山老师告诉了大家因为黄宿舍成员都搬离使自己感到非常寂寞才使用了这个办法，之后和大家一起分享了自己做的咖喱，剑山表示自己会偶尔回黄宿舍看看。

在十代“失踪”期间为了证明谁对“大哥”的“思念”更强烈而和丸藤翔进行了决斗。之后又接受了斋王琢磨的挑战，输给斋王琢磨后剑山由于有恐龙DNA的缘故不被斋王琢磨操控也不受“光之波动”的任何影响。

十代回来后，和所有学院的学生前往童实野町进行修学旅行，在这期间被迫接受斋王的妹妹美寿知的考验，和翔的组队决斗中输给了冰丸、雷丸后被封入虚拟世界，后被游城十代和爱德·菲尼克斯救出。

在斋王琢磨控制下的奥金王子启动了能摧毁地球的镭射卫星“苏拉”，为了拯救世界一方面十代在“光之结社”和斋王琢磨决斗，另一方面剑山被元素英雄 新生侠带入宇宙（剑山在宇宙中变为恐龙的形态）摧毁“苏拉”，最终十代战胜了斋王琢磨，元素英雄 新生侠也和剑山一起摧毁了镭射卫星，拯救了世界。

由于大家察觉到了最近的怪异事件，所以剑山等人一起前往了怪异电波的发出地点——废弃地下研究所进行调查，收到这种电波的影响动物们都变得暴躁了起来，这时具有恐龙DNA的剑山也受到了影响无意识地强行和人决斗，吉姆·克劳戴尔·库克接受了决斗，最终吉姆赢得了胜利使剑山恢复了理智。

后因“尤贝尔”的关系，决斗学院被传送到异世界，在两个世界的通力合作之下，游城十代等人成功地让决斗学院回到原来的世界。但为了迷失在异世界的约翰·安德森，十代等人再次前往异世界，在这里每场决斗都必须赌上性命。剑山在这时被暗黑界的怪物抓去并被“邪心教典”的“憎之珠”附身，在十代和暗黑界怪兽决斗时灵魂被封印在了其他次元，十代与尤贝尔灵魂融合后剑山恢复原状，剑山回到了原本的世界。

剑山在决斗学院的第二学年即将结束，这也意味着“大哥”游城十代将要毕业离开自己。作为在校生的代表的剑山开展了一系列活动，最大的活动就是组队决斗了。在组队决斗在剑山和早乙女礼组队一路连胜，最终和“大哥”十代的队伍碰上了，虽然剑山输掉了决斗但是很开心。

之后“DAEKNESS”开始大举入侵，“DAEKNESS”的手下Mr.T假扮在校学生空野大吾和剑山展开了决斗，最终剑山输给了Mr.T的幻术战术而被卷入了“DAEKNESS”的世界。最终在十代与“DAEKNESS”的战斗中由于十代的呼唤使大家战胜了在一直在“DAEKNESS”的世界所无限循环的绝望回到了决斗学院。后十代打败了“DAEKNESS”。

在游城十代和丸藤翔等前辈的毕业典礼上，作为在校生代表的剑山需要进行讲话，原本准备了大段演讲稿的剑山却因为不舍与“大哥”等前辈的分别而在讲台上泣不成声，最终为了不妨碍毕业典礼的正常进行剑山被多美婶等人强行推了出去。

十代和武藤游戏决斗后在背包里找到了剑山和丸藤翔、天上院明日香、万丈目准等人一起给自己留了赠言。