①基因组功能研究；

② 遗传工程的基础与开发应用研究。研究领域涉及人类遗传学、医学遗传学、遗传工程学、群体和进化遗传学。

实验室依靠国家投入的建设经费建立仪器中心，配备了进行遗传工程和分子遗传学研究所需要的各种仪器设备，包括：用于分子生物学研究的DNA序列分析仪，PCR仪，超速离心机，HPLC，质谱仪，园二色仪，毛细管电泳仪；用于细胞分析的共聚焦显微镜，荧光显微镜，流式细胞仪；以及进行生物信息学分析研究的SGI工作站等大型设备。

实验室遵循“合作、开放、提高”的原则，强调与国内有关单位的科研协作，协助本校生化系，微生物系，物理系等28个课题组的科研实验，与国家人类基因组南方研究中心、第二军医科大学、苏州大学（医学院）等15个科研单位建立了合作关系。积极参与国际性学术活动，已主办过发育遗传学与生物工程国际学术研讨会，第九届国际环境诱变剂大会和2002现代人类学国际研讨会等5次国际学术会议；与法国Pasteur 研究所，美国Yale大学等著名研究机构建立了多项国际合作项目；并组建了3个实质性的国际联合实验室（人类起源中美联合实验室、复旦－交大－诺丁汉植物生物技术中心、复旦－曼切斯特大学生物信息中心）。先后接待国内外访问者近2500人。科技部，教育部，基金委及上海市领导也多次莅临指导和视察。