那曲物流中心以青藏铁路那曲站为高新区的交通枢纽；充分利用青藏铁路、青藏公路的联通功能，形成产业区的两条重要发展轴。将已有的西藏那曲物流园区、西藏那曲高新技术产业开发区与西藏那曲综合保税区，有机融合后划分为若干个子功能区，在空间的布局上，形成“两轴线、四功能、七区域”的结构。同时合理设置绿地保护区域，使各板块之间形成衔接过渡和缓冲带，与现有城区既紧密结合又相对独立，使高新区与那曲旧城有机互动，实现功能补充、协调双赢的基本规划目的，并最终辐射周边。

七大区域：高新技术产业开发区（新兴产业推广区、特色产业生产加工区、现代多功能综合服务区）、综合保税区（现代进出口物资仓储区、集装箱吊装区）、现代物流区、公路集散中心。