邱立本于香港圣多马小学毕业，初中就读九龙塘的银禧中学，1967年毕业于李求恩中学，负笈台湾。1972年台湾政治大学经济系本科毕业，后赴美留学，获纽约New school for Social Research经济学硕士，曾任柏克莱加州大学亚美历史研究员，香港大学兼职教授。

历任台北《中国时报》国际新闻编译，纽约《星岛日报》、《北美日报》，旧金山《远东时报》，洛杉矶《美洲中国时报》，纽约《美洲中国时报》，纽约《中报》记者、编辑、总编等职务。1990年返回香港，任《亚洲周刊》主笔。1993年出任《亚洲周刊》总编辑至今。1995-1996年兼任《明报月刊》总编辑。