郡大溪位于台湾省中部，属于浊水溪水系，为丹大溪主流 (最长河道) 上游，流域分布于南投县信义乡中部至东南部。郡大溪主流上游为哈伊拉罗溪，发源于海拔标高3,377米之马利加南山东峰北侧，先向西北流，汇集发源自入东郡大山的马戛英溪后转向西流，于无双社附近汇入郡大溪本流，再转北流至巴巴隆附近注入丹大溪。

郡大溪本身发源于海拔标高3,765米之马博拉斯山西南侧，先西后转北流，于无双社附近与哈伊拉罗溪合流。