明正德二年（1507年）乡试中举人，闻王守仁（字文成，号阳明）讲学东南，遂与同邑吴良吉（仲修）徒步前往求学。在学三年，勤奋努力，充然有得，为王守仁得意弟子。学成归里，王守仁有《送郭善甫归学》一文。

正德六年（1511年），授清平知县，为官清廉勤政，受民爱戴。去官归里后，清平县官民为其建生祠祀之。家居潜心著述讲学，喜好吟咏。与户部尚书黄安耿定向、群痒吴良吉等会讲邑问津书院，并担任书院管理（山长）之职。在任期礼请王守仁、湛若水等名师来问津书院讲学布道。在书院传授王守仁创立的“陆王心学”，继邹守益后进一步继承和发扬了“姚江学派”在问津书院的学术地位。《王阳明全集》载有“与郭善甫书”等文献。

明隆庆元年（1567年），受黄州郡守孙光祖礼聘，助郡守重修书院孔庙，并派员往山东曲阜孔庙塑请孔夫子圣像（圣像毁于文革）於孔庙祭祀。为之后人彰美传盛，郭公还在其家后，建有“也名馆”书屋，不少人文墨客前往讲学浏览。师王明阳先生于经略巡湖广常访郭公于也名馆，并亲题“一坡书屋”，时赠联于门楼：