新中国成立后，郭晓棠调回河南省工作。1950 年秋，他被调任河南大学文学院副院长兼政治系主任； 1953 年8月，任河南师范学院教务长，接着担任中共河南师范学院党组书记兼副院长；1957年2月，调任中共河南省委宣传部常务副部长，并兼任省委机关理论刊物《中州评论》副主编； 1961 年，任郑州大学副校长；1964年，任河南省社会科学联合会主席。在“文化大革命”运动前，他还曾当选为河南省第一、二、三、四届人民代表大会代表，河南省政协常务委员。从1950年起，在学术活动方面他连续发表论文100余篇、专著4部。论文散见在《河南大学学报》、《河南日报》、《河南师范学院学报》、《中州评论》《郑州大学学报》上。4部专著为： 《历史主义还是反历史主义》；《中国革命的历史道路》；《共产主义者同盟和《共产党宣言》》；《关于社会主义建设理论的几个问题》。他在担任河南大学领导职务期间，把中国人民大学的教学、科研经验传入母校，促进了我校教育质量的提高。当河南大学转变为高等师范院校后，一些师生员工难以适应这种变动，他作为院党组书记在困难面前毫不畏缩，而是斗志昂扬，和学校其他领导同志齐心协力，认真贯彻党的教育方针，全面落实党的知识分子政策。他深入教学第一线，组织和带领师生员工学习马克思主义基本理论、教育理论，学习部颁高等师范院校的方针任务和教学计划，使学校很快确立了为社会主义建设事业培养合格师资的办学方向。他特别重视培养中青年教师，努力提高师资队伍素质。他教导中青年教师在学术领域中要坚持马克思主义的科学研究方向，提倡要认真读书和自得之学的学习方法。他把培养青年助教作为教研室的一项基本任务提出来，使青年教师很快成为教学中的骨干力量。1953年9月，他亲自主持制定中青年教师进修计划，派出30名中青年教师到中国人民大学进修，校内则让老教师对青年助教传、帮、带，各教研室每星期都固定一次教学研讨时间，集体讨论教材教法，互相取长补短等。到1954 年，全校助教110人中，有38人开课，占35%。他为我校中青年教师的成长呕心沥血，做出了重大的贡献。郭晓棠是河南大学的一位杰出校友，对母校怀着特殊的、深厚的感情。无论是在旧中国他从母校毕业后，还是在新中国他调离母校后，他都以一颗赤诚的心始终关心母校的发展。1940年11月，时任中共河南省委宣传部长兼统战部长，到嵩县潭头河南大学流亡地开展统战工作，分别拜访文学院院长嵇文甫、化学系主任李俊甫和经济系主任王毅斋等教授，倾听老师的意见，研究河南大学工作方针及对敌斗争策略，使河南大学抗日民族统一战线更加牢固，有力促进了母校抗日救亡运动的蓬勃开展。1960年7月，母校举行第一次教学第五次科学讨论会，郭晓棠应邀回到开封与会，在母校大礼堂向全校师生员工作了题为《谈学术与政治》的长篇报告。他以自己渊博的学识，谈了学术与政治的辩证统一关系，热情宣传党的“百花齐放、百家争鸣”的方针，使这次教学科研学术会议取得了很大的成功。