相比之下，凯撒可供支配的资源大都来自意大利。这种罗马优先的军政体系，可以充分的调集本土资源。加上有常年追随其作战的精锐军团，在效率和执行力层面都更胜一筹。但资源的相对匮乏，还是让他们必须不断追求速战速决。经常会为了追求出其不意，在所有准备工作稳妥前就提前动手。既能让敌人大吃一惊，也容易使自己陷入危险境地。但若非如此善于冒险，凯撒的大部分军事成就便根本难以树立。

公元前49年冬季，迅速扩编的共和派海军已基本控制了亚得里亚海。庞贝将来自雅典、亚该亚、奇里乞亚、叙利亚和埃及的舰队评价分配，逐次防御迪拉基乌姆到阿波罗尼亚直接的海岸线。

尽管在一些反攻意大利边缘城镇的作战中失败，稳固的基本盘却不可能就此动摇。按照其判断，凯撒也不可能在春季来临前做好渡海准备。他们甚至更希望对手放弃海路，转而走漫长的陆路进入伊利里亚山区。

当然，凯撒的决策基础就是有违常理。在从意大利、西西里和西班牙凑出首批运输船后，就马上让先头部队强渡亚得里亚海。虽然浪高风大的冬季被认为不适宜航行，但在这个阶段出击也能回避对手拦截。

事实上，庞贝的海军的确因时节而放松警惕，大都停泊在科孚岛过冬。这得以让凯撒在无战舰护卫的情况下，将整整7个军团的部队投送到伊利里亚边区。然而，当天气好转且巡逻船发现其踪迹后，缺乏掩护的运输船便遭到敌方的无情打击。这也意味着凯撒和他的先头部队已经被困在庞培的大本营之外。

之后的几个月时间内，庞贝依然留在阿波罗尼亚附近集结和训练部队。他的海军则为封锁凯撒的7个军团而卖力作战。然而，古典时代的技术条件让封锁效果变得差强人意。

大量从东方城市凑出的3-4列桨战舰，只有非常低下的支持能力。尤其当许多船只集中使用，就需要为士兵、水手和大量划桨奴的口粮操心。他们显然不可能从忠于凯撒的意大利沿岸获得补给，也无法从对手军团占领的伊利里亚得到支援。除了对特定目标进行打了就跑的策略，不能长期在海面保持连贯存在。他们曾尝试以沿海的无人岛为前沿基地，却发现那里缺乏淡水而困难重重，还是不能解决固有问题。

凯撒同样为自己的海路不畅感到困扰，他的冒进举动使自己和军队都陷入了战略死地。但广袤而多元的伊利里亚城镇却迫于压力，不断向其提供各种补给。一些意大利东部城镇的忠诚，也牵制了某些庞贝舰队的主要精力。加上技术条件对海上封锁的严重限制，就给了孤悬巴尔干的他们以众多生机。当凯撒确信留守后方的安东尼又聚集起另外半数船只，就下令他把余下的4个军团带到前线。后者也不辱使命，仅仅因风力阻碍才偏离了的原先预设登陆场位置。

此时，凯撒已在巴尔干战区握有兵力优势。他麾下的11个主要军团成功登陆，而老对手庞贝的兵力还没能完全集中。尤其是来自叙利亚的2个军团，刚刚从海上抵达希腊，正在穿越北方的马其顿山区。惟一的问题，在于安东尼带来的援军位置过于靠北，也没能和凯撒的主力马上会合。

于是，一场激烈的追逐在两位罗马巨头之间展开。无论凯撒还是庞贝，都急于向北靠近安东尼军团的登陆场。前者希望尽快聚集起优势部队，后者则要努力阻止两支敌军的胜利会师。况且庞贝的部队走沿海路线，进军速度还稍稍快于凯撒。部分坐船北上的陆战队和同盟骑兵，就前线一步，成功堵在了凯撒与安东尼的11个军团之间。

然而，共和派阵营里有大量新手和复员老兵，整体素质不如那些在高卢血战多年的精锐。结果，凯撒的主力军便以更快的前进速度抵达周遭区域，大有将共和派部队的反截断威胁。追求稳健的庞贝，便将前突部队撤回，退到滨海城市迪拉基乌姆附近扎营。

到公元前48年的夏季，凯撒也集中全部兵力靠近迪拉基乌姆，意图与庞贝进行大规模决战。除了11个军团的罗马公民步兵，还有自高卢边区招募的骑兵和辅助部队。自己身边也有一支由日耳曼骑士组成的私募力量。这支超过30000人的野战部队，善战程度超过共和派阵营的大部分杂牌。倘若在亚得里亚海便重创对手，则可以瞬间摧毁元老院势力的核心。迪拉基乌姆城本身也扼守着巴尔干边陲的重要海岸，还储存有大量从海外运来的粮草军备，足以解决凯撒阵营的后勤困难。当然，庞贝的军队也扩增到3万人以上。除去海军和防御城镇的辅助力量，依然有充沛人力进行长期消耗。

为了压缩共和派军队的活动空间和补给，凯撒施展出自己在高卢和西班牙的成功经验。他下令士兵利用内陆一侧的山峦扎营，并大量修筑边墙、壕沟与塔楼，从而以漫长的防御工事封锁住敌军营地。他的最大军营就位于对方营垒和城市之间，切断了庞贝主力与迪拉基乌姆城的道路联系。

深谙罗马军事策略的后者，也下令部署以同样的方式构筑阵地，针锋相对地展开工程学较量。两伙人就这样一起挥汗如雨，不断延伸彼此的防区面积，形成一种另类的施工赛跑。由于共和派军队人数更多，再次抢先完成了主要作业。凯撒也分兵进攻迪拉基乌姆城，并继续尝试向南端延伸自己的防线。

至此，庞贝部下的许多优势因攻坚战而无法有效发挥。那些来自色萨利、马其顿、色雷斯和东方的骑兵，都无法冲出两军之间的无人区。但连人带马的日常消耗却必不可少。幸好靠着主帅下令扎营时的先见之明，几条溪流的淡水供应被保护下来。应急粮草也由舰船不断从海上输送过来。庞贝甚至让人开辟出临时农场，在防御工事内种植口粮，大大抵消了凯撒所期望达到的封锁效果。困守迪拉基乌姆的分队，也因海峡阻隔与舰船保护而长期坚持，死死护住城内的战略储备。然而，无论凯撒如何调兵挑衅对面，庞贝都下令士兵闭门不出。

此后，在凯撒继续实施扩张战略的南翼，就成为双方重点争夺的对象。当庞贝从5个军团中派抽调步兵占据了一座山头，就遭到对方阵营中的第9军团反扑。依靠暂时的数量和素质优势，瞬间将共和派士兵刚刚开建的胸墙阵地摧毁。然而，庞贝并不愿就此放弃，转而派出更多步兵大队反击，双方便在山头爆发了激烈争夺。同时，大批憋屈已久的轻步兵和骑兵从营地中出来，包抄了凯撒军右翼。巨大的伤亡和恐惧，让一代军神的属下惊慌失措。但依靠更加顽强的战斗意志，才终于将反扑者逐出阵地。

不过，凯撒的麻烦还只是刚刚开始。他手下的2个高卢贵族军官，因被人揭发贪污军饷而选择叛逃。庞贝也因他们泄密而知道，对方重点营建的南部防线存在安全隐患。他们为防备共和派士兵从海上迂回反击，不得不同时修筑2座边墙。但工作量和前方冲突拖累了施工进展，使得2面墙之间存在没有闭合的空档。

庞贝当机立断，挑选部分精锐轻装部队坐船靠近那里，并以手里全部的7个军团发起正面突击。不知有诈的凯撒，也立刻调集全部人马到南北两头针锋相对。当两军在弩炮和重标枪齐射后发生近战，共和派的海军陆战队已成功冲入了2道护墙之间。部署在那里的凯撒军士兵，再面临双重包夹，在数量众多的敌军压迫下撤退。对方也立刻打开工事缺口，让来自各地的同盟骑兵得以驰骋。

凯撒的士兵便无法继续支撑，争先恐后地向己方阵线溃逃。哪怕有凯撒亲自赶往现场阻止溃退，也挡不住士兵争相涌入营地。若非庞贝见好就收的叫停了战斗，扬名高卢的战神可能就此遭遇惨败。但共和派士兵还是很快在南侧建立的一座崭新营垒，从而打破了敌手施于自己的陆上封锁。凯撒若要重回先前局面，就必须出动更多人来进行反攻，或是向外重新延伸防御工事。然而，麾下士兵的疲态与斗志消磨，让他看到了继续下去的严重风险。

在几个月的对峙作战中，凯撒阵营已损失了近4000名士兵。长期的固定驻扎，也让战区周围的补给品被逐渐消耗完毕。庞贝的营垒不仅巍然不动，甚至依靠海路后勤而慢慢占据上风。

于是，已经贵为名将的凯撒决定后撤，有史以来的首次承认自己遭遇重大挫折。不过，高卢老兵依然在困境中秩序井然，甚至没有让对方察觉自己的真正意图。庞贝也害怕凯撒是在佯装后撤，所以没有让部下贸然去攻。这场迪拉基乌姆战役便以自己的小胜而告终。他不仅逼迫凯撒主动撤离，自身伤亡数字也仅有对方的50%不到。

此后，凯撒为尽快摆脱后勤困境，并吸引共和派与自己野外决战，决定朝着内陆的帖撒利地区撤退。庞贝则顺利与来自马其顿方向的叙利亚军团会合，开始不紧不慢地战略追击。双方的恩恩怨怨，将在稍后的法萨罗战役中才做出了断。