1987年，经中国人民银行总行批准成为全国最早与农业银行脱离行政隶属关系的六家农村信用联社之一；1998年，经原中国人民银行浙江省分行批准，成为沪、浙、闽地区首家实施一级法人核算管理试点的信用联社；2001年11月，实施组建农村合作银行的试点，并于2003年3月25日获批复同意开业，同年4月8日正式对外挂牌营业。鄞州银行属于股份合作制性质银行。

初步建立以防范信用风险为核心的现代农村合作银行风险管理制度体系，资产质量不断得以优化，财务成果可持续增长。