在端午设置种种可驱邪的花草，来源亦久。最早的如挂艾草于门，《荆楚岁时记》：“采艾以为人，悬门户上，以禳毒气。”这是由于艾为重要的药用植物，又可制艾绒治病，灸穴，又可驱虫。五月艾含艾油最多，(此时正值艾生长旺期)所以功效最好，人们也就争相采艾了。除采艾扎作人外，也将艾扎作虎形，称为艾虎，《荆楚岁时记》注文云：“以艾为虎形，或剪彩为小虎，帖以艾叶内人争取戴之。”同时也在门上挂蒲束及葛蒲削的蒲剑，蒲束扎的蒲龙。《帝京岁时纪胜》：“(端午)插蒲龙艾虎。”《清嘉录》卷五：“戴蒲为剑，割蓬作鞭，副以桃梗蒜头，悬于床户，皆以却鬼。”

端午还有许多辟邪、灭疫活动，与上述的卫生习俗有密切的联系。如以五色丝系臂，曾是很流行的节俗。汉代应助《风俗通义》有记：“五月五日，赐五色续命丝，俗说以益人命。”《荆楚岁时记》载：“以五彩丝系臂，名曰辟兵，令人不病瘟。”另外又有称长命缕、续命缕、辟兵绍、五色缕、朱索等。据说也是因屈原而起，可以驱除灾害。