民国35年（1946年）2月，学校添办高中及幼稚园，至此完成巴蜀学校基础教育体系，学校名称亦为“重庆市私立巴蜀中学校”。

1949年9月，筹建巴蜀文商学院，后未能完成建立。

1950年，私立巴蜀学校董事会决定将学校无条件捐献给人民政府办理；同年12月，西南军政委员会接办巴蜀学校为西南局干部子弟校，由私立变为公立。

1954年，巴蜀学校交由重庆市教育局直管，高中一个年级从原来的两个班扩大到8个班。

1955年8月，巴蜀学校一分为三，按已有的重庆市中学序号，中学部被定名为重庆市四十一中学校，成为市级重点中学。

1958年起，各种运动打乱了学校的正常教育教学秩序，学校教学质量受到很大影响。

1963年以后，学校各项工作恢复。

1966年，重庆市四十一中学校停止初高中招生，教育教学工作一度中断。

1969年8月，学校恢复初中招生。

1971年下半年，学校恢复高中招生，高中学制采用两年制（至1984年）。

1978年，重庆市四十一中学校被确定为四川省首批重点中学。

1981年，重庆市四十一中学校被正式列为“四川省首批办好的重点中学”。

1991年，上级主管部门同意将“四川省重庆市第四十一中学校”更名为“四川省重庆市巴蜀中学校”，这实际上是恢复了学校在1954年以前的名称。

1998年，学校正式更名为“重庆巴蜀中学校”。

2006年10月，被评为北京2008奥林匹克教育示范学校。

2007年12月，被评为汉语国际推广中小学基地。

2009年，被评为北京大学校长实名推荐制中学。

2011年10月，被评为清华大学自主选拔“新百年领军计划”推荐资格中学。

2015年，学校移交渝中区教育委员会管理。

2020年7月，被评为普通高中新课程新教材实施国家级示范校。

2021年1月，重庆市巴蜀中学校滨江校区开始建设。

截至2023年11月，璧山巴蜀中学教学楼、学生宿舍、科技楼、食堂、教师公寓已完成封顶，封顶楼栋占比约80%，正式进入二次结构施工，玉泉湖公园已正式开园投入使用，市政道路工程已完成土石方和管网施工，玉泉湖一路跨河桥正进行上部结构现浇箱梁施工。

据2022年9月学校官网显示，学校占地面积540亩，教学建筑面积20多万平方米；有学生一万余人。

据2022年9月学校官网显示，学校有教职工一千余人，其中有享受国务院特殊津贴专家4人，特级教师15人，研究员（正教授级）15人，重庆市名师、学科名师11人，高级教师270余人，全国先进工作者3人，全国“五一”劳动奖章获得者1人，全国优秀教师（教育工作者）9人，重庆市优秀教师、优秀班主任、优秀教育（德育）工作者33人，国家级骨干教师10人，重庆市骨干教师56人，博士4人，硕士130余人。

国务院政府特殊津贴专家：王国华、傅唯泉、张勇、曹黎枫

全国教育系统先进工作者：傅唯泉

全国师德先进个人：傅唯泉

全国优秀语文教师：张学忠

全国优秀教师：黄宏生

特级教师：蒋兆弟、张恩富、张志建、郭昭全、唐良沐、李壮虎

研究员：蒋兆弟、张恩富、张志建、张学忠、江崇明、刘同凡、李忠铮、郑川珍

重庆市有突出贡献的中青年专家：王国华、刘雅林

重庆市名师：张学忠、秦德胜

重庆市学科名师：杨斌

重庆市骨干教师：杨斌

（注：名单不全）

据2022年9月学校官网显示，学校建有近万平方米的室内体育馆，11700平方米塑胶田径场，标准足球场，4个标准篮球场，10个羽毛球场；拥有礼堂、理化生专用实验室、图书馆、多媒体语音室、多功能教学厅、学术报告厅、演播厅和考试监控中心等；每间教室装有两台柜式冷暖空调、电教设施；有学生公寓，每间寝室有空调、电话、写字台、壁柜、卫生间浴室等设施。

2019年6月，学校学生入选全国“新时代好少年”先进事迹1人；同年8月，学校学生在第28届全国中学生生物学奥林匹克竞赛中，获金牌3人、银牌1人；同月，学校学生在第十八届中国女子数学奥林匹克竞赛（CGMO）中，获金牌1人；9月，学校学生在第35届全国高中数学联赛中，获一等奖36人、二等奖（三等奖）100余人，入围2019年第35届中国数学奥林匹克（冬令营）10人。2020年8月，学校学生在第二十九届全国生物联赛（重庆赛区）中，获一等奖32人；同月，学校学生在第19届中国女子数学奥林匹克竞赛（CGMO）中，获金牌2人；同年10月，学校学生在第29届全国中学生生物学奥林匹克竞赛中，获金牌10人、银牌1人，入选国家集训队7人；同月，学校学生在重庆市2020年中学生田径锦标赛中，获金牌6项；11月，学校学生在第37届全国中学生物理竞赛中，获金牌3人、银牌1人，入选国家集训队1人；同月，学校学生在2020年重庆市中学生排球锦标赛中，获第一名1项；12月，学校学生在第34届中国化学奥林匹克（决赛）中，获金牌3人、银牌1人，入选国家集训队2人；同月，学校学生在全国青少年信息学奥林匹克联赛中，获一等奖22人。

2021年6月，学校学生在重庆市第六届运动会中，获冠军1项；同年7月，学校学生在第38届全国青少年信息学奥林匹克竞赛中，获金牌2人、银牌5人，入选省队7人；同月，学校学生在第32届国际生物学奥林匹克竞赛中，获金牌4人；8月，学校学生在第30届全国中学生生物学联赛（重庆赛区）中，获一等奖39人；9月，学校学生在第37届全国高中数学联赛中，获全国一等奖20人、入选省队9人；10月，学校学生在重庆市中小学生艺术展演活动中，获一等奖3项；同月，学校学生在第30届全国中学生生物学奥林匹克竞赛中，获金牌3人、银牌7人，入选全国集训队1人；11月，学校学生在全国中学生化学奥林匹克竞赛（重庆赛区）中，获全国一等奖30人、入选省队6人；同月，学校学生在全国中学生生物奥林匹克竞赛（重庆赛区）中，获全国一等奖39人、入选省队11人；12月，学校学生在2021年中国数学奥林匹克竞赛中，获金牌6人，入选国家集训队2人；同月，学校学生在全国青少年信息学奥林匹克联赛（NOIP2021）中，获一等奖17人。

2022年3月，学校学生在USAD（美国学术十项全能竞赛）中，获西南地区第一、全国前十；同月，学校学生在FBLA（全美未来商业领袖挑战赛）中，获银行与金融系统全国第一；同年4月，学校学生入选第63届国际数学奥林匹克（IMO）中国国家队1人；7月，学校学生在第31届全国中学生生物学联赛（重庆赛区）中，获全市一等奖33人，入选重庆市代表队10人；同月，学校学生在第63届国际数学奥林匹克（IMO）中，获金牌1人；8月，学校学生在第39届全国青少年信息学奥林匹克竞赛中，获金牌3人、银牌1人，入选国家集训队3人；同月，学校学生在第31届全国中学生生物学奥林匹克竞赛中，获金牌5人、银牌5人，入选国家集训队2人；同月，学校学生在第21届中国女子数学奥林匹克竞赛中，获金牌2人。

2020年1月，学校教师在2019年重庆市高中英语教师优质课大赛中，获一等奖2人；同年10月，学校教师在第九届全国初中语文教师教学基本功大赛中，获优秀课例评比全国一等奖1人；12月，学校学生在了2020年重庆市初中历史教师优质课比赛决赛中，获一等奖1人。

2021年5月，学校教师在重庆市高中生物学优质课决赛中，获一等奖1人；同年10月，学校教师在重庆市第二届中小学主题班会及微班会课评选中，获一等奖1人。2022年5月，学校教师在2022年重庆市高中信息技术优质课大赛决赛中，获一等奖1人。

截至2020年10月，近三年，学校中国教育学会规划课题5项，重庆市普通高中教育教学改革研究课题重大课题2项、重点课题7项、一般课题6项，重庆市社科联课题2项，重庆市教育学会立项课题16项，重庆市教育科学规划课题重点课题15项、规划课题18项；近五年，学校累计到校科研经费1000余万元。

据2022年9月学校官网显示，学校获全国德育先进学校、全国艺术教育先进学校、全国少年儿童科学体验活动优秀示范学校、重庆市“五一劳动奖状”、重庆市教育系统办公室工作先进集体、重庆市校园文化建设示范学校、重庆市文明单位、重庆市民主管理示范学校、渝中区教育科研先进集体、大溪沟地区精神文明建设暨创文明城区工作先进集体等称号。

2020年11月20日，入选“第二届全国文明校园”名单。2022年5月，重庆市巴蜀中学校团委被授予2022年“重庆市五四红旗团委”称号。

据2022年9月学校官网显示，学校先后与美国、英国、新加坡等国进行国际交流与合作，并开展了美国、欧洲、新加坡等多种留学项目，并在欧洲、北美等地区建立了近十所国际友好学校，包括英国爱丁堡圣乔治女子学校，英国巴京艾彼人文体育学校等。学校先后承办全国、重庆市各类活动100余个，其中主要承办有1996年全国创造教育年会，2001年全国中学生第五届国际象棋比赛，2009年第二届汉语桥世界中学生中文比赛，2010年第三届汉语桥世界中学生中文比赛，2011年第四届汉语桥世界中学生中文比赛，2013年承办全国中小学财商教育教师培训会，2014年承办中国教育学会财商教育中心成立暨中小学财商教育年会、第30届全国中学生数学奥林匹克竞赛，2015年承办全国首届中小学文学社团高峰论坛，2017年全国“拔尖创新人才培养与选拔”高校高中教育发展论坛等会议、赛事。

据2022年9月学校官网显示，学校通过“领雁工程”“捆绑发展”“帮扶计划”，先后对重庆市第六十六中学校、秀山洪雅中学、重庆市黔江民族中学校、垫江九中、重庆市涪陵高级中学校、垫江六中、上璜中学、养鹿中学等进行了物质和教育教学帮扶，并与重庆市第四十二中学校、重庆市第五十七中学校结成巴蜀中学教育集团。1999年9月，学校与企业创办“重庆市渝北区龙湖花园巴蜀学校”并正式开学。2001年9月，学校与企业创办“龙湖花园巴蜀学校小学部”并正式开学。2003年，成立国际部。2004年9月，与企业在金科天籁域内修建的一所学校投入使用。2006年9月，重庆市巴蜀中学与奉节永安中学联合创办的“重庆市巴蜀渝东中学”正式开学。2007年9月，学校参与举办的股份制民营学校“重庆市鲁能巴蜀中学校”建立；同年，学校与英国爱丁堡的圣乔治女子学校开设孔子课堂。2011年，学校在美国纽约州建孔子课堂。2015年9月，学校参与创办的涪陵巴蜀中学正式开学；同月，学校参与举办的诺林巴蜀外籍人员子弟学校开学。2017年9月，学校全面管理的公立两江巴蜀中学开学；同月，学校全面管理的民办重庆巴蜀常春藤学校开学。

公正诚朴

截至2022年6月，学校有现代ACG文化研究社、模联社、棋社、摄影社、山间文学社、商业及金融社、心理社、巴蜀剧团等学生社团门类近40个，开展了社团联合展演活动、夏日音乐会、“纵横杯”辩论赛、社团文化节、社团活动周等学生活动。