1994年12月至2004年06月，担任中国人民解放军农牧大学（军需大学）军事兽医研究所研究室主任。

1994年12月，担任中国人民解放军基因工程实验室主任。

1995年08月，成为中国共产党党员。

1998年，获得国家杰出青年科学基金资助。

2004年06月，在中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所工作。

2007年08月，担任吉林省人兽共患病防控科技创新中心主任。

2011年11月，担任吉林省病毒重组疫苗研发工程研究中心主任。

2015年12月，当选中国工程院院士。

1982年以来，金宁一在烈性病毒性病原分离、病毒分子流行病学、病毒基因组克隆、病毒分子流行病学、病毒结构基因的功能及其表达调控、病毒活载体系统平台构建、病毒基因工程重组疫苗、人兽共患病毒病防治、快速诊断和生物高技术相关产品开发等研究方面做出贡献，已成为分子病毒学、动物传染病学等学科带头人。

金宁一创建了“吉林省人兽共患病防控科技创新中心”和“吉林省病毒重组疫苗研发工程研究中心”，培养了大批人才，培育了创新活跃的研究团队，并带领团队历经30年完成“重要动物病毒病防控关键技术研究与应用”体系，提升了中国动物病毒病研究与防控水平。

截至2016年11月，金宁一先后在中国国内外知名期刊发表研究论文389篇；主编参编专著9部。

截至2016年11月，金宁一先后主持国家自然科学基金等各类课题85项。

截至2016年11月，金宁一先后获得国家科学技术进步奖一等奖1项，省部级科技进步奖一等奖4项、二等奖5项；授权国家发明专利12项。

2018年9月6日，金宁一做客华中农业大学动物医学院“创新、创造、创业”高端论坛，在农业微生物学国家重点实验室B座103报告厅作了题为《共患病毒病与防控》的学术报告。

2018年12月9日，金宁一在国家重点实验室北107报告厅为广西大学动物科学技术学院师生做了题为《共患病毒病与防控》的学术报告。

截至2016年11月，金宁一作为第一导师或合作导师向军内外输送博士、硕士研究生共计175名。

金宁一特别是在病原、流行病学、诊断和疫苗等病毒病防控理论和关键技术研究方面取得了突出成绩。（中国畜牧兽医学会评）

金宁一长期从事病原发现、流行病学、生态背景、病毒基因组功能、病毒载体系统构建、常规疫苗与新型疫苗、快速侦检、人兽共患病综合防治和生物高技术相关产品研发等研究领域形成了明显的优势和特色，并取得了突出成就。（温州大学生命与环境科学学院评）

金宁一躬耕科研一线，他是病毒学领域的战斗者；培育优秀人才，他是因严谨求真而为学生爱戴的老师；挽救生命于危亡，他是广大人民抗击病毒的“保护伞”；打造民族之魂，他是至诚报国、匠心筑梦的时代弄潮儿。从“修身齐家治国平天下”到“天下兴亡，匹夫有责”，在金宁一身上，我们看得见“苟利国家生死以，岂因祸福避趋之”的决心，看得到“忧以天下，乐以天下”的愿望，看的到“虽千万人吾往矣”的勇毅与豪迈。（延边大学评）