根据百度百科蝌蚪团章程，每年年末，综合百度百科核心用户和百度百科官方的意见，评选出一名蝌蚪团成员获得金蝌蚪奖，并给予特别奖励。

2007年，百科蝌蚪团颁发第一届金蝌蚪奖。

2018年，百科蝌蚪团首次设置金蝌蚪提名奖并颁发。