钟萼桐科的学名Schlegeliaceae由模式属钟萼桐属学名Schlegelia的复合形式Schlegeli-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“钟萼桐属”中的专名“钟萼桐”加上“科”字构成。其单纯的中文别名有夷地黄科，详见钟萼桐属条目的“词源”一节。