1998年起就在中国国家队执教，最先在女队当教练，2000年后进入男队教练组工作，做过中国男二队主教练。

2013年起到2016年，在二队担任教练，其执教生涯基本都是在中国国家队度过的。

2017年7月21日，据韩联社报道称，韩国乒乓球协会决定聘任中国队前教练员钟金勇为韩国女子乒乓球队教练员，聘任合同截至2018年雅加达亚运会结束。

2020年当选中国乒乓球国青男队主教练。

2023年1月4日，中国乒乓球协会公布竞聘结果，钟金勇担任国家队教练员。

2023年1月20日，中国乒协公布了最新的国乒主管教练分管球员情况。教练钟金勇分管的球员有陈梦、张瑞、王晓彤、韩菲儿。