锡林浩特站建于2002年。

2022年6月13日，生态环境部制发《关于太子城至锡林浩特铁路环境影响报告书的批复》，太锡铁路北迄锡多铁路锡林浩特站。太锡铁路线路涉及锡林浩特市、阿巴嘎旗、正蓝旗和太仆寺旗4个旗市，分别设太仆寺旗站、正蓝旗站、桑根达来北站、锡林浩特站4个客运站。

2023年9月22日，随着最后一方混凝土浇筑完成，由中铁电气化局承建的太子城至锡林浩特铁路内蒙古段工程锡林浩特站房混凝土主体结构顺利封顶，为站房后期钢结构安装和装饰装修施工奠定了良好基础。10月，太锡铁路锡林浩特站改工程施工顺利完成，该站是太锡铁路内蒙古段站改工程最后一座车站，标志着太锡铁路内蒙古段取得重大进展。

锡林浩特站是太锡铁路内蒙古段面积最大的站房，位于内蒙古自治区锡林郭勒盟锡林浩特市，站房建筑面积12000㎡，地下架空层面积15000㎡，站房长155m，宽53m，建筑总高度22.8m，两侧平屋面高度16.8m，车站为线侧平式站房，设3站台14线。