唐天宝元年（742年），苏州又改为吴郡。长洲县属之。

唐乾元元年（758年），改吴郡为苏州。翌年，废长洲县，改置长洲军。

唐大历十二年（777年），废长洲军，仍置长洲县。

宋政和三年（1113年），苏州升为平江府，长洲县属之。

元至元十三年（1276年），改平江府为平江路，长洲县属之。

元至正十六年（1356年），张士诚占平江，改平江路为隆平府。次年，张士诚降元，复改隆平府为平江路。至正二十三年，张士诚自立为吴王，建都平江城（今苏州城）。至正二十七年（1367年）、朱元璋吴元年，朱元璋部将徐达攻占平江城，改平江路为苏州府。长洲县先后属之。

清代，1724年（清雍正二年），由于长洲县人口、赋税繁多，分出其南部设立元和县（东南），与吴县（西南）、长洲县（东北）3县同治于府城内，同为苏州府的附郭县。长洲县下设吴塔巡司，初设今常熟市辛庄镇常南村，1731年（雍正九年）移驻浒墅关。宣统三年十月初四（1911年11月24日），民国临时政府裁苏州府及长洲、元和、吴三县，设苏州。