福建陆军第1师 师长 姚建屏

福建陆军第2师 师长 臧致平

福建陆军第3师 师长 王献臣

1918年4月，闽粤战事发生，北京政府委任李厚基与浙军师长董保暄为援粤军正副总司令，李厚基在厦门设援粤军总司令部。9月，李部被打败。11月，徐树铮又调王永泉率奉天补充旅入闽。1919年1月，改编为中央陆军第24旅。同年，李厚基怀疑第1师师长姚建屏与王永泉有勾结，遂将第1师番号撤销。1920年，直皖战争后，李厚基见皖系失败，直系得势，便弃皖投直。

1922年，段（祺瑞）、张（作霖）、孙（中山）反直三角联盟形成后，北京政府委任李厚基为讨逆总司令，萨镇冰为副司令，率海、陆军从厦门实施反攻，并令毅军常德盛从江西人杉关增援。10月，李厚基被皖系臧致平战败，逃离福建；赣军也在王永泉、许崇智两部阻击下退回江西。曹锟、吴佩孚乃令孙传芳率北洋陆军第2师，并指挥周荫人的北洋陆军第12师于1922年冬分由鄂、赣援闽。

孙传芳、周荫人率部入闽后，北京政府于1923年3月任命孙传芳为福建军务督理，王永泉任军务帮办兼兴（化）、泉（州）、永（春）护军使，周荫人任闽北护军使。孙督理福建后，认为王永泉实力不可低估，因此极力收编福建各路杂牌军及各地民军，并将收编的李厚基旧部和民军先后编为福建陆军第1、第2、第3师和第7、第8、第9旅。

孙传芳任福建军务督理时闽军主要编制序列（1923年）

福建军务督理孙传芳

军务帮办兼护军使王永泉

闽北护军使 周荫人

陆军第1师师长张毅任

陆军第2师师长高义任

陆军第3师师长王献臣

陆军第7旅旅长任定国

陆军第8旅旅长陈国辉

陆军第9旅旅长杨汉烈

但为时不长，第7、第8、第9旅均投归福建建国军。1924年3月，孙传芳将皖系的王永泉、臧致平打败，其残部由臧致平、杨化昭率领突围经赣闽边人浙,投奔卢永祥。同年5月，孙传芳调任闽粤边防督办，由周荫人任福建督理。周接任后，即对留闽各军进行整编，除第1、第2、第3师不变外，又将原王永泉部扩编为福建陆军第1、第2旅。

9月，北京政府任命孙传芳为浙江军务督理兼闽浙巡阅使，孙率第1旅入浙，周荫人又重建第1旅，董胜标任旅长，并新建第3旅，苏埏任旅长。接着，向不听号令的民军兴师问罪。12月，围歼了驻扎泉州、南安的福建陆军第2师高义部。

1925年初，又相继新建了第4、第5旅和福建补充旅。此后，周为巩固自己在福建的统治地位，又对福建各部进行了整编，另以中央陆军第12师第24旅扩编为第3师；以第12师卫队旅扩编为第4师。

周荫人督军福建时闽军编制序列

闽军总司令 周荫人

第一师师长 张毅

第一旅 旅长 李芳池

第二旅 旅长 田宝琴

第二师 师长 李凤翔

第三旅 旅长 曹万顺

第四旅 旅长 杜起云

第三师 师长 刘俊

第四师 师长 孙云峰

第一旅 旅长 董胜标

第二旅 旅长

第三旅 旅长 苏埏

第四旅 旅长 张庆昶

第五旅 旅长 吴大洪

补充旅 旅长 蒋启凤

海军陆战队混成旅 旅 林忠

1926年10月，何应钦率北伐军入闽，一举攻占永定城，端掉周荫人 的前线指挥部，周率卫队仓皇逃走。恰在此时，闽军第2师宣布战场起 义，并倒戈向其他闽军攻击，使闽军阵脚大乱，不是被歼，就是投降。12 月18日，北伐军进驻福州城。周荫人率所部北洋军入浙，与孙传芳军会合。