阮健文出身于香港09，2006年加盟香港08，首度在香港甲组足球联赛亮相。一季后，转投“升班马”华家堡。

2008年，华家堡宣布解散，阮健文加盟香港甲组足球联赛新军天水围飞马。

2009年12月在香港举行的东亚运动会，阮健文有份入选香港奥运足球代表队，而且全部4场比赛均有上阵(1场正选3场后备入替)，并且在准决赛对北朝鲜，互射12码时射入1球，是香港夺金功臣之一。

到了2011年夏天，阮健文遭天水围飞马弃用，遂转投香港乙组足球联赛球队愉园。

2012-13年度球季，阮健文重返甲组作赛的老牌球会流浪。